11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2468 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2468  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3468  hypothetical protein  93.2 
 
 		 127 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773986  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2300  hypothetical protein  92 
 
 		 78 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.750268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5247  hypothetical protein  46.94 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5157  hypothetical protein  46.94 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.50237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5302  hypothetical protein  46.94 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0087  hypothetical protein  40.59 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0071  hypothetical protein  40.86 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.664883  hitchhiker  0.0000574078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0087  hypothetical protein  41.25 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.723367  hitchhiker  0.00000000000806538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0090  hypothetical protein  36.56 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218001  hitchhiker  0.0000147409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4773  hypothetical protein  36.23 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0890871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>