14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5362 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5362  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  214  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.11263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4916  hypothetical protein  85.19 
 
 		 108 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000285344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0341  hypothetical protein  58.62 
 
 		 77 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.930967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4043  hypothetical protein  54.39 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.131676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4773  hypothetical protein  48.28 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0890871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3667  hypothetical protein  38.04 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000951062  decreased coverage  0.00000000000750539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3661  hypothetical protein  43.53 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000704866  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4069  hypothetical protein  38.04 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000330915  unclonable  0.000000659796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1807  hypothetical protein  36.96 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.512803  normal  0.194465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1771  hypothetical protein  36.67 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372178  decreased coverage  0.000314834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0090  hypothetical protein  34.48 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218001  hitchhiker  0.0000147409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0087  hypothetical protein  30.48 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0071  hypothetical protein  29.91 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.664883  hitchhiker  0.0000574078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0087  hypothetical protein  33.82 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.723367  hitchhiker  0.00000000000806538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>