10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2300 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2300  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.750268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3468  hypothetical protein  94.87 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773986  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2468  hypothetical protein  92 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5247  hypothetical protein  43.48 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5157  hypothetical protein  43.48 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.50237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5302  hypothetical protein  43.48 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0071  hypothetical protein  36 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.664883  hitchhiker  0.0000574078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0087  hypothetical protein  38.46 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0087  hypothetical protein  33.78 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.723367  hitchhiker  0.00000000000806538 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0090  hypothetical protein  35.38 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218001  hitchhiker  0.0000147409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>