14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5302 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5302  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5157  hypothetical protein  95.88 
 
 		 97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.50237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5247  hypothetical protein  94.85 
 
 		 132 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0071  hypothetical protein  71.58 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.664883  hitchhiker  0.0000574078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0087  hypothetical protein  71.58 
 
 		 105 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0090  hypothetical protein  69.47 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218001  hitchhiker  0.0000147409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0087  hypothetical protein  67.82 
 
 		 101 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.723367  hitchhiker  0.00000000000806538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2468  hypothetical protein  46.94 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3468  hypothetical protein  47.78 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773986  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2300  hypothetical protein  43.48 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.750268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4773  hypothetical protein  30.85 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0890871 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.841238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0693  hypothetical protein  30.43 
 
 		 89 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000477278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0691  hypothetical protein  30.43 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000978963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>