260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1908 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1908  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 164 aa  340  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.938438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2982  flavodoxin/nitric oxide synthase  74.21 
 
 		 163 aa  247  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00353782  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2642  flavodoxin  37.33 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.66337  normal  0.959919 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3094  flavodoxin  46.46 
 
 		 149 aa  90.9  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  35.14 
 
 		 153 aa  90.9  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0898  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.45 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4053  flavodoxin  45.45 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3082  flavodoxin  45.45 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3742  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.18 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329047  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3170  flavodoxin  35.81 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660936  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1473  YbhB and YbcL  36 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0922  flavodoxin  44.44 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02635  flavodoxin  44.44 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3105  flavodoxin  35.14 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02597  hypothetical protein  44.44 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.917177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2934  flavodoxin  44.44 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3123  flavodoxin  35.14 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.941554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3186  flavodoxin  35.14 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.551035 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3243  flavodoxin  34.9 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.207571 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3285  flavodoxin  35.14 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.339839  normal  0.738816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1061  flavodoxin  35.71 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.238271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1008  flavodoxin  35.71 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3440  flavodoxin  35.71 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3168  flavodoxin  33.55 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2930  flavodoxin  44.44 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0673  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2986  flavodoxin  33.11 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4183  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.72 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1806  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.76 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4216  flavodoxin  32.89 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000001981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4309  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.47 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0001  flavodoxin  32.89 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285908  normal  0.657203 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0001  flavodoxin  32.89 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000145912  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1438  flavodoxin  29.11 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3365  flavodoxin  32.43 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.294622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3170  flavodoxin  34.19 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1474  flavodoxin  29.11 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3795  flavodoxin  31.76 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00043068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4247  flavodoxin  31.03 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4537  flavodoxin  33.1 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.186367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2909  flavodoxin  28.48 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129799  normal  0.479147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2649  flavodoxin  31.33 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2716  flavodoxin  31.33 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1443  flavodoxin  28.48 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1341  flavodoxin  30.92 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1622  flavodoxin  32.28 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0936  flavodoxin  36.75 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000373319  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2823  flavodoxin  31.33 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  38.71 
 
 		 614 aa  75.1  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1186  flavodoxin  35.9 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35635  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  37.75 
 
 		 614 aa  75.1  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1692  flavodoxin  35.71 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1899  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.03 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4907  flavodoxin  31.51 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204961  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3983  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.8 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0897  flavodoxin  34.9 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19660  flavodoxin  35.06 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.16255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04097  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.87 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0001  flavodoxin  31.58 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.337726  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  38.89 
 
 		 969 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  29.05 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2516  flavodoxin  33.33 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000882543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3588  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.77 
 
 		 148 aa  72  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  35.71 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  35.71 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  35.71 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  35.71 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1132  flavodoxin  29.86 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3937  flavodoxin  31.76 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  36.27 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000640858  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  28.28 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  28.28 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4029  flavodoxin  31.76 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36 
 
 		 607 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0003  flavodoxin  31.08 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  hitchhiker  0.0000119397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3857  flavodoxin  29.05 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000243053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03036  flavodoxin  33.1 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.230795  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  34.69 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1024  flavodoxin  33.33 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  34.69 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.67 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4377  flavodoxin  29.33 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0171898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  33.67 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4519  flavodoxin  29.33 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.480433  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  33.67 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4378  flavodoxin  28 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000023992  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  37.1 
 
 		 628 aa  68.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4910  flavodoxin  29.05 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.1 
 
 		 629 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1263  flavodoxin  27.81 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.644769  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4252  flavodoxin  31.08 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  28.28 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.1 
 
 		 626 aa  68.2  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0001  flavodoxin  29.73 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002018  flavoprotein MioC  27.45 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00370796  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4323  flavodoxin  28.67 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.413593  hitchhiker  0.0000000000612205 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00434  flavodoxin  36.46 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  27.59 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  27.59 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  28.86 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>