271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1008 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1008  flavodoxin  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3440  flavodoxin  99.33 
 
 
149 aa  303  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1061  flavodoxin  99.33 
 
 
149 aa  303  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.238271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3795  flavodoxin  81.21 
 
 
149 aa  255  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00043068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2986  flavodoxin  67.11 
 
 
149 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0936  flavodoxin  68.92 
 
 
151 aa  217  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000373319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3365  flavodoxin  68.92 
 
 
151 aa  218  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.294622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3170  flavodoxin  68.24 
 
 
150 aa  217  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3123  flavodoxin  66.89 
 
 
149 aa  209  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.941554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3105  flavodoxin  66.89 
 
 
149 aa  209  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3170  flavodoxin  66.89 
 
 
149 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660936  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3186  flavodoxin  66.22 
 
 
149 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.551035 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0898  flavodoxin/nitric oxide synthase  66.22 
 
 
149 aa  207  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3082  flavodoxin  66.22 
 
 
149 aa  207  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4053  flavodoxin  66.22 
 
 
149 aa  207  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3285  flavodoxin  66.22 
 
 
149 aa  207  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.339839  normal  0.738816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3094  flavodoxin  66.22 
 
 
149 aa  207  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0922  flavodoxin  65.54 
 
 
149 aa  205  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02635  flavodoxin  65.54 
 
 
149 aa  205  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02597  hypothetical protein  65.54 
 
 
149 aa  205  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.917177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2934  flavodoxin  65.54 
 
 
149 aa  205  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2930  flavodoxin  64.86 
 
 
149 aa  203  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3243  flavodoxin  61.07 
 
 
149 aa  202  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.207571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  48.97 
 
 
153 aa  141  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2649  flavodoxin  44.3 
 
 
154 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2716  flavodoxin  44.3 
 
 
154 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1341  flavodoxin  45.64 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2823  flavodoxin  43.62 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1622  flavodoxin  44.97 
 
 
154 aa  137  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2642  flavodoxin  47.65 
 
 
154 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.66337  normal  0.959919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3168  flavodoxin  46.62 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745936  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1438  flavodoxin  42.95 
 
 
154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3588  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.52 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2909  flavodoxin  41.61 
 
 
154 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129799  normal  0.479147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1443  flavodoxin  41.61 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1474  flavodoxin  41.61 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1263  flavodoxin  41.67 
 
 
154 aa  123  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.644769  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1806  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.52 
 
 
153 aa  120  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1132  flavodoxin  40.94 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2890  flavodoxin  40.54 
 
 
154 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  39.58 
 
 
150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03036  flavodoxin  42.96 
 
 
149 aa  104  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.230795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19660  flavodoxin  38.51 
 
 
150 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.16255  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1473  YbhB and YbcL  37.93 
 
 
149 aa  100  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3283  flavodoxin  37.41 
 
 
149 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4628  flavodoxin  39.6 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4488  flavodoxin  39.6 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1692  flavodoxin  38.46 
 
 
150 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4612  flavodoxin  41.26 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263285  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3742  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.42 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329047  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0897  flavodoxin  39.73 
 
 
151 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0813  flavodoxin  37.16 
 
 
151 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.06 
 
 
148 aa  96.7  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4907  flavodoxin  37.66 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204961  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1024  flavodoxin  40 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4183  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.57 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0001  flavodoxin  37.66 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000145912  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4216  flavodoxin  37.66 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000001981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0001  flavodoxin  37.66 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285908  normal  0.657203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1186  flavodoxin  36.11 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35635  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002018  flavoprotein MioC  32.86 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00370796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4247  flavodoxin  34.23 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3937  flavodoxin  32.64 
 
 
146 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104179 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00434  flavodoxin  33.57 
 
 
146 aa  88.6  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4537  flavodoxin  33.56 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.186367  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2516  flavodoxin  32.86 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000882543  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4029  flavodoxin  31.94 
 
 
146 aa  87.4  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  32.89 
 
 
159 aa  87  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000640858  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3983  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.05 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0003  flavodoxin  31.94 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  hitchhiker  0.0000119397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1908  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.71 
 
 
164 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.938438 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  32.21 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  32.21 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2982  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.1 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00353782  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4252  flavodoxin  33.33 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  32.21 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  32.21 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.89 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0001  flavodoxin  30.56 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  32.89 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  32.21 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  32.21 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4519  flavodoxin  31.51 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.480433  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4377  flavodoxin  31.51 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0171898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4910  flavodoxin  31.94 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4323  flavodoxin  31.51 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.413593  hitchhiker  0.0000000000612205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  32.21 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  32.21 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  32.21 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  32.21 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0001  flavodoxin  31.08 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.337726  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  32.21 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4378  flavodoxin  30.82 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000023992  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4057  flavodoxin  29.05 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  34.51 
 
 
631 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1706  flavodoxin  29.79 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3857  flavodoxin  30.56 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000243053 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  36.43 
 
 
584 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  40 
 
 
1370 aa  78.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  31.54 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>