More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0767 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0767  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 88 aa  175  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1315  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 74 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000270736  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1371  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 74 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0976  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 74 aa  105  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.844523  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0336  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  104  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1115  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000159264  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2690  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2375  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19760  translation initiation factor 1  65.28 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00431201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  58.67 
 
 		 75 aa  103  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01400  translation initiation factor 1  65.28 
 
 		 72 aa  103  6e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0644583  normal  0.998737 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  103  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0738  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 73 aa  102  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  65.28 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1809  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0718  translation initiation factor 1  60.53 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0426  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249384  normal  0.130241 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2255  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2296  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  61.11 
 
 		 73 aa  101  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1163  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 73 aa  101  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296746  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4004  translation initiation factor IF-1  68.57 
 
 		 73 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000265509  hitchhiker  0.000014317 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3644  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000405996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0312  translation initiation factor IF-1  57.5 
 
 		 83 aa  100  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120042  unclonable  9.19989e-29 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  100  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0232  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 75 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3002  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 73 aa  100  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.275871  hitchhiker  0.00604316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0229  translation initiation factor IF-1  60 
 
 		 75 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00409892  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3296  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0154  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  100  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0297  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00110331  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3725  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0238444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3623  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000249232  hitchhiker  0.0000000000154943 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3755  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0935334  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  99.4  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3468  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623681  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2818  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196542  normal  0.235424 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000744837  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0270  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712061  normal  0.0408075 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3047  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0335  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170612  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3783  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.752054  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2738  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  99.4  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0288  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0369  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0348  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  98.6  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0238  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197943  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3276  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759571 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1249  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  98.6  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000018307  normal  0.0943393 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1399  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5148  translation initiation factor IF-1  63.01 
 
 		 73 aa  98.2  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.594538 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01568  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2611  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.430163  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003955  translation initiation factor 1  59.72 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000363825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1338  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0544501  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1945  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06135  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 78 aa  98.2  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0613852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3317  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.795368  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01031  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 78 aa  98.2  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00987912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0445  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3499  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3148  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655502  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3422  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4222  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  97.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.271914  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1346  translation initiation factor IF-1  59.15 
 
 		 83 aa  98.2  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0496  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1285  translation initiation factor IF-1  59.15 
 
 		 83 aa  98.2  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  98.2  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1837  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0378537  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  97.4  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  97.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>