More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4187 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0460  putative aldehyde dehydrogenase  80.46 
 
 		 476 aa  816    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5120  conifer aldehyde dehydrogenase, putative  73.1 
 
 		 476 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0418  coniferyl aldehyde dehydrogenase  74.79 
 
 		 475 aa  716    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5345  aldehyde dehydrogenase  78.99 
 
 		 476 aa  795    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5170  aldehyde dehydrogenase  75.16 
 
 		 476 aa  723    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4187  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 476 aa  976    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4994  aldehyde dehydrogenase  73.32 
 
 		 474 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04810  putative aldehyde dehydrogenase  80.88 
 
 		 476 aa  820    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0345  aldehyde dehydrogenase  73.32 
 
 		 480 aa  707    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.403687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3572  aldehyde dehydrogenase  61.54 
 
 		 481 aa  625  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.072637  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2982  aldehyde dehydrogenase  54.51 
 
 		 474 aa  547  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3332  aldehyde dehydrogenase  55.38 
 
 		 474 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1028  Aldehyde Dehydrogenase  55.16 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.889075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1040  aldehyde dehydrogenase  55.16 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.820564 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0982  aldehyde dehydrogenase  58.82 
 
 		 485 aa  546  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0975  aldehyde dehydrogenase  54.98 
 
 		 473 aa  545  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1007  aldehyde dehydrogenase  54.95 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2855  coniferyl aldehyde dehydrogenase  56.01 
 
 		 479 aa  545  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4064  aldehyde dehydrogenase  54.59 
 
 		 479 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3716  coniferyl aldehyde dehydrogenase  54.33 
 
 		 476 aa  542  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0872  aldehyde dehydrogenase  54.72 
 
 		 474 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3150  aldehyde dehydrogenase  54.72 
 
 		 474 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3683  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.86 
 
 		 474 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3103  aldehyde dehydrogenase  54.82 
 
 		 474 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3251  aldehyde dehydrogenase  54.94 
 
 		 474 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3357  aldehyde dehydrogenase  52.64 
 
 		 475 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  50.74 
 
 		 475 aa  525  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3428  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.52 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.841636  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0937  aldehyde dehydrogenase  52.74 
 
 		 473 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2938  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.6 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2151  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.6 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3273  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.6 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.6 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0214  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.6 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.6 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0226  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.39 
 
 		 472 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3253  aldehyde dehydrogenase  52.09 
 
 		 487 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0133422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0016  aldehyde dehydrogenase  52.64 
 
 		 475 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6421  aldehyde dehydrogenase  53.93 
 
 		 480 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3090  aldehyde dehydrogenase  53.4 
 
 		 480 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0192  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.6 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2458  aldehyde dehydrogenase  53.4 
 
 		 480 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0388363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3072  aldehyde dehydrogenase  53.4 
 
 		 480 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2579  aldehyde dehydrogenase  52.76 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0172  coniferyl aldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 		 472 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4636  aldehyde dehydrogenase  51.83 
 
 		 490 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2982  aldehyde dehydrogenase  53.02 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3118  aldehyde dehydrogenase  53.23 
 
 		 480 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3068  aldehyde dehydrogenase  53.62 
 
 		 480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3764  Aldehyde Dehydrogenase  51.27 
 
 		 472 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2747  aldehyde dehydrogenase  50.33 
 
 		 510 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0601156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0158  aldehyde dehydrogenase  53.53 
 
 		 467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4460  Aldehyde Dehydrogenase  50.32 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244749  hitchhiker  0.00200414 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7472  aldehyde dehydrogenase  50.45 
 
 		 491 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1085  aldehyde dehydrogenase  46.67 
 
 		 490 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1294  aldehyde dehydrogenase  48.76 
 
 		 511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0117  aldehyde dehydrogenase  47.94 
 
 		 476 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5413  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  49.34 
 
 		 477 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6016  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  48.29 
 
 		 483 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596098  normal  0.623763 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6847  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 		 473 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4813  Aldehyde Dehydrogenase  48.04 
 
 		 479 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2304  aldehyde dehydrogenase  47.96 
 
 		 476 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5677  aldehyde dehydrogenase  49.56 
 
 		 491 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6041  aldehyde dehydrogenase  49.56 
 
 		 491 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0711456 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1092  coniferyl aldehyde dehydrogenase  45.91 
 
 		 475 aa  440  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.500272  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4344  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 475 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1058  aldehyde dehydrogenase family protein  50.98 
 
 		 466 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1378  aldehyde dehydrogenase  48.13 
 
 		 470 aa  435  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.283338  hitchhiker  0.000287193 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000269  aldehyde dehydrogenase  47.87 
 
 		 470 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4903  Aldehyde Dehydrogenase  48.04 
 
 		 479 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0679006  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0996  aldehyde dehydrogenase family protein  50.33 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0782  aldehyde dehydrogenase  45.7 
 
 		 484 aa  430  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.790584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1325  aldehyde dehydrogenase  50.8 
 
 		 465 aa  425  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5226  aldehyde dehydrogenase  46.47 
 
 		 479 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1332  hypothetical protein  46.22 
 
 		 462 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0175  aldehyde dehydrogenase  48.4 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1991  aldehyde dehydrogenase  49.12 
 
 		 460 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05634  aldehyde dehydrogenase  48.55 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1336  hypothetical protein  46.67 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3846  aldehyde dehydrogenase  47.66 
 
 		 477 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0048  aldehyde dehydrogenase  46.48 
 
 		 483 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2547  Aldehyde Dehydrogenase  47.53 
 
 		 481 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3195  aldehyde dehydrogenase  47.31 
 
 		 496 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  48.65 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1636  aldehyde dehydrogenase  45.3 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2218  aldehyde dehydrogenase  47.24 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0696851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3971  Aldehyde Dehydrogenase  49.44 
 
 		 469 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3272  aldehyde dehydrogenase  45.96 
 
 		 472 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5205  aldehyde dehydrogenase  46 
 
 		 498 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1351  Aldehyde Dehydrogenase  43.87 
 
 		 472 aa  398  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1214  putative NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  48.03 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1883  Aldehyde Dehydrogenase  46.84 
 
 		 477 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1251  aldehyde dehydrogenase  46.54 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502305  hitchhiker  0.0082854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3382  Aldehyde Dehydrogenase  43.04 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3601  aldehyde dehydrogenase  47.57 
 
 		 481 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3791  aldehyde dehydrogenase  47.26 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0661  aldehyde dehydrogenase  40.57 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0951  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.89 
 
 		 468 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1067  Aldehyde Dehydrogenase  42.89 
 
 		 468 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4336  aldehyde dehydrogenase  41.89 
 
 		 494 aa  359  7e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>