More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2855 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3683  coniferyl aldehyde dehydrogenase  70.15 
 
 
474 aa  701    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3716  coniferyl aldehyde dehydrogenase  69.83 
 
 
476 aa  687    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425789  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3357  aldehyde dehydrogenase  68.9 
 
 
475 aa  666    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2982  aldehyde dehydrogenase  69.73 
 
 
474 aa  695    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1028  Aldehyde Dehydrogenase  68.96 
 
 
474 aa  696    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.889075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3332  aldehyde dehydrogenase  68.75 
 
 
474 aa  692    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1040  aldehyde dehydrogenase  68.75 
 
 
474 aa  694    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.820564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4064  aldehyde dehydrogenase  72.36 
 
 
479 aa  687    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0975  aldehyde dehydrogenase  66.24 
 
 
473 aa  646    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3103  aldehyde dehydrogenase  69.55 
 
 
474 aa  687    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0872  aldehyde dehydrogenase  70.15 
 
 
474 aa  700    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3150  aldehyde dehydrogenase  69.94 
 
 
474 aa  699    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0937  aldehyde dehydrogenase  67.1 
 
 
473 aa  652    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3251  aldehyde dehydrogenase  70.64 
 
 
474 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1007  aldehyde dehydrogenase  68.54 
 
 
474 aa  692    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2855  coniferyl aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
479 aa  993    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0841165  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  62.21 
 
 
475 aa  634  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4187  aldehyde dehydrogenase  56.49 
 
 
476 aa  549  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3572  aldehyde dehydrogenase  54.47 
 
 
481 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.072637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3428  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  54.86 
 
 
471 aa  543  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.841636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04810  putative aldehyde dehydrogenase  53.86 
 
 
476 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0460  putative aldehyde dehydrogenase  54.08 
 
 
476 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5345  aldehyde dehydrogenase  54.76 
 
 
476 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4994  aldehyde dehydrogenase  55.65 
 
 
474 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000269  aldehyde dehydrogenase  56.67 
 
 
470 aa  528  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5170  aldehyde dehydrogenase  54.21 
 
 
476 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0345  aldehyde dehydrogenase  55 
 
 
480 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.403687  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5120  conifer aldehyde dehydrogenase, putative  55.22 
 
 
476 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0418  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.43 
 
 
475 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1092  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.2 
 
 
475 aa  498  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.500272  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05634  aldehyde dehydrogenase  57.27 
 
 
470 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0175  aldehyde dehydrogenase  52.93 
 
 
480 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2151  coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
472 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2938  coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
472 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3273  coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
472 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0214  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
472 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
472 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
472 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0226  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  51.29 
 
 
472 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3090  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
480 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2458  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
480 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0388363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3072  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
480 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0192  coniferyl aldehyde dehydrogenase  50.86 
 
 
472 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6421  aldehyde dehydrogenase  49.37 
 
 
480 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3118  aldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2982  aldehyde dehydrogenase  49.14 
 
 
480 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3764  Aldehyde Dehydrogenase  49.57 
 
 
472 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3068  aldehyde dehydrogenase  49.06 
 
 
480 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0172  coniferyl aldehyde dehydrogenase  49.14 
 
 
472 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4636  aldehyde dehydrogenase  48.37 
 
 
490 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325559  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0982  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
485 aa  448  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2579  aldehyde dehydrogenase  48.5 
 
 
478 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0016  aldehyde dehydrogenase  47.7 
 
 
475 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2304  aldehyde dehydrogenase  47.7 
 
 
476 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5413  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  48.16 
 
 
477 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0117  aldehyde dehydrogenase  47.07 
 
 
476 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4344  aldehyde dehydrogenase  47.97 
 
 
475 aa  428  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261334  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7472  aldehyde dehydrogenase  47.98 
 
 
491 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5226  aldehyde dehydrogenase  45.09 
 
 
479 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5677  aldehyde dehydrogenase  47.76 
 
 
491 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6041  aldehyde dehydrogenase  47.76 
 
 
491 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0711456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2747  aldehyde dehydrogenase  45.28 
 
 
510 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0601156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0158  aldehyde dehydrogenase  47 
 
 
467 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6016  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  44.12 
 
 
483 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596098  normal  0.623763 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1332  hypothetical protein  43.96 
 
 
462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1294  aldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 
511 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2547  Aldehyde Dehydrogenase  45.75 
 
 
481 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3195  aldehyde dehydrogenase  45.32 
 
 
496 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3253  aldehyde dehydrogenase  43.35 
 
 
487 aa  405  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0133422  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1085  aldehyde dehydrogenase  43.44 
 
 
490 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0782  aldehyde dehydrogenase  43.24 
 
 
484 aa  405  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.790584  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2218  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 
474 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0696851 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1336  hypothetical protein  43.14 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1251  aldehyde dehydrogenase  47.8 
 
 
478 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502305  hitchhiker  0.0082854 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4813  Aldehyde Dehydrogenase  42.44 
 
 
479 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167418  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1325  aldehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
465 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1058  aldehyde dehydrogenase family protein  44.74 
 
 
466 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0996  aldehyde dehydrogenase family protein  44.08 
 
 
470 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4903  Aldehyde Dehydrogenase  42.8 
 
 
479 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0679006  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5205  aldehyde dehydrogenase  44.55 
 
 
498 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3382  Aldehyde Dehydrogenase  47.02 
 
 
472 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3971  Aldehyde Dehydrogenase  43.92 
 
 
469 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1991  aldehyde dehydrogenase  42.21 
 
 
460 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1214  putative NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.83 
 
 
477 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173506  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3272  aldehyde dehydrogenase  42.52 
 
 
472 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0225308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4460  Aldehyde Dehydrogenase  42.86 
 
 
473 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244749  hitchhiker  0.00200414 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6847  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
473 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  41.47 
 
 
477 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1636  aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 
473 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290647  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4336  aldehyde dehydrogenase  42.47 
 
 
494 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215144  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1351  Aldehyde Dehydrogenase  43.25 
 
 
472 aa  364  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0821  Aldehyde Dehydrogenase  41.65 
 
 
475 aa  361  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0672695  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3846  aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3601  aldehyde dehydrogenase  45.2 
 
 
481 aa  353  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0048  aldehyde dehydrogenase  40.3 
 
 
483 aa  353  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4268  Aldehyde Dehydrogenase  39.39 
 
 
462 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1378  aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
470 aa  350  3e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.283338  hitchhiker  0.000287193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3791  aldehyde dehydrogenase  44.98 
 
 
477 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5442  aldehyde dehydrogenase  38.28 
 
 
486 aa  350  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274338  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0489  aldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
459 aa  348  9e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0498787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>