More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0975 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2982  aldehyde dehydrogenase  66.81 
 
 		 474 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4064  aldehyde dehydrogenase  67.94 
 
 		 479 aa  642    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3683  coniferyl aldehyde dehydrogenase  67.44 
 
 		 474 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1028  Aldehyde Dehydrogenase  68.28 
 
 		 474 aa  667    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.889075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3103  aldehyde dehydrogenase  65.35 
 
 		 474 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1007  aldehyde dehydrogenase  67.86 
 
 		 474 aa  665    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0975  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 473 aa  981    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3332  aldehyde dehydrogenase  68.7 
 
 		 474 aa  669    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0872  aldehyde dehydrogenase  67.65 
 
 		 474 aa  669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3150  aldehyde dehydrogenase  68.07 
 
 		 474 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0937  aldehyde dehydrogenase  68.28 
 
 		 473 aa  674    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3251  aldehyde dehydrogenase  67.86 
 
 		 474 aa  660    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3716  coniferyl aldehyde dehydrogenase  65.13 
 
 		 476 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1040  aldehyde dehydrogenase  68.28 
 
 		 474 aa  666    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.820564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2855  coniferyl aldehyde dehydrogenase  66.24 
 
 		 479 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3357  aldehyde dehydrogenase  64.78 
 
 		 475 aa  624  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0988  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  61.76 
 
 		 475 aa  608  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4187  aldehyde dehydrogenase  54.9 
 
 		 476 aa  541  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04810  putative aldehyde dehydrogenase  53.13 
 
 		 476 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0460  putative aldehyde dehydrogenase  52.92 
 
 		 476 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4994  aldehyde dehydrogenase  53.15 
 
 		 474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5345  aldehyde dehydrogenase  54.07 
 
 		 476 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3428  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  54.29 
 
 		 471 aa  511  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.841636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3572  aldehyde dehydrogenase  51.52 
 
 		 481 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.072637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5170  aldehyde dehydrogenase  52.35 
 
 		 476 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000269  aldehyde dehydrogenase  55.94 
 
 		 470 aa  509  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0418  coniferyl aldehyde dehydrogenase  52.92 
 
 		 475 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0345  aldehyde dehydrogenase  52.49 
 
 		 480 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.403687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1092  coniferyl aldehyde dehydrogenase  53.88 
 
 		 475 aa  498  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.500272  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5120  conifer aldehyde dehydrogenase, putative  52.49 
 
 		 476 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05634  aldehyde dehydrogenase  55.7 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0175  aldehyde dehydrogenase  49.57 
 
 		 480 aa  477  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0982  aldehyde dehydrogenase  50.69 
 
 		 485 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3090  aldehyde dehydrogenase  47.64 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6421  aldehyde dehydrogenase  48.28 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2458  aldehyde dehydrogenase  47.64 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0388363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3072  aldehyde dehydrogenase  47.64 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2982  aldehyde dehydrogenase  46.57 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2151  coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 		 472 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2938  coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 		 472 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3273  coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 		 472 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0226  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.47 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2579  aldehyde dehydrogenase  48.12 
 
 		 478 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 		 472 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0214  putative coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 		 472 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0192  coniferyl aldehyde dehydrogenase  47.54 
 
 		 472 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3068  aldehyde dehydrogenase  48.19 
 
 		 480 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.919224 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3409  coniferyl aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 		 472 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3118  aldehyde dehydrogenase  46.57 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4636  aldehyde dehydrogenase  46.07 
 
 		 490 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0016  aldehyde dehydrogenase  46.93 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0172  coniferyl aldehyde dehydrogenase  45.92 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7472  aldehyde dehydrogenase  44.83 
 
 		 491 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2304  aldehyde dehydrogenase  45.83 
 
 		 476 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5677  aldehyde dehydrogenase  45.83 
 
 		 491 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3764  Aldehyde Dehydrogenase  45.92 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6041  aldehyde dehydrogenase  45.83 
 
 		 491 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0711456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3253  aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 		 487 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0133422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0158  aldehyde dehydrogenase  46.02 
 
 		 467 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5413  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  45.2 
 
 		 477 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0782  aldehyde dehydrogenase  43.13 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.790584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4344  aldehyde dehydrogenase  44.8 
 
 		 475 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5226  aldehyde dehydrogenase  43.16 
 
 		 479 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2747  aldehyde dehydrogenase  43.19 
 
 		 510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0601156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6016  coniferyl aldehyde dehydrogenase (CALDH)  44.44 
 
 		 483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596098  normal  0.623763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2547  Aldehyde Dehydrogenase  44.81 
 
 		 481 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3195  aldehyde dehydrogenase  44.37 
 
 		 496 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3971  Aldehyde Dehydrogenase  43.9 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0117  aldehyde dehydrogenase  43.79 
 
 		 476 aa  398  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2218  aldehyde dehydrogenase  42.27 
 
 		 474 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0696851 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1058  aldehyde dehydrogenase family protein  45 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0704571  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3272  aldehyde dehydrogenase  46.17 
 
 		 472 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225308 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4813  Aldehyde Dehydrogenase  42.46 
 
 		 479 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1325  aldehyde dehydrogenase  44.37 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0996  aldehyde dehydrogenase family protein  44.35 
 
 		 470 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1991  aldehyde dehydrogenase  42.42 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1351  Aldehyde Dehydrogenase  44.44 
 
 		 472 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1332  hypothetical protein  44.65 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4903  Aldehyde Dehydrogenase  41.67 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0679006  normal  0.531166 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3382  Aldehyde Dehydrogenase  43.74 
 
 		 472 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5205  aldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1336  hypothetical protein  44.65 
 
 		 469 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1294  aldehyde dehydrogenase  44.09 
 
 		 511 aa  376  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3846  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4460  Aldehyde Dehydrogenase  41.98 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244749  hitchhiker  0.00200414 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1251  aldehyde dehydrogenase  46.01 
 
 		 478 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502305  hitchhiker  0.0082854 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1085  aldehyde dehydrogenase  41.97 
 
 		 490 aa  375  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6847  aldehyde dehydrogenase  41.27 
 
 		 473 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  40.96 
 
 		 477 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0048  aldehyde dehydrogenase  41.42 
 
 		 483 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1214  putative NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.94 
 
 		 477 aa  359  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1636  aldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 		 473 aa  358  8e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.290647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3601  aldehyde dehydrogenase  44.5 
 
 		 481 aa  351  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0489  aldehyde dehydrogenase  41.83 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0498787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1378  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 		 470 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.283338  hitchhiker  0.000287193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1883  Aldehyde Dehydrogenase  40.31 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0607  aldehyde dehydrogenase  38.89 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4268  Aldehyde Dehydrogenase  40 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0334  Aldehyde Dehydrogenase  41.5 
 
 		 465 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0165  Aldehyde Dehydrogenase  40.27 
 
 		 459 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0486514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>