21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3184 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3184  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 136 aa  273  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.056903  normal  0.102185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3779  GCN5-related N-acetyltransferase  54.89 
 
 		 148 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.72634  normal  0.0513749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1331  GCN5-related N-acetyltransferase  57.85 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4558  acetyltransferase  57.85 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4348  GCN5-related N-acetyltransferase  51.88 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1599  acetyltransferase, GNAT family  53.38 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.693259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3858  GCN5-related N-acetyltransferase  57.5 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4065  GCN5-related N-acetyltransferase  57.94 
 
 		 122 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4294  hypothetical protein  30.97 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354309  hitchhiker  0.0000950095 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000885364  hitchhiker  0.000586382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00242  acetyltransferase  30 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002161  predicted acyltransferase  32.2 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.839978  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2715  hypothetical protein  27.82 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000871455  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0645  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0202346  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1265  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000595975  hitchhiker  0.00335305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0017  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0633142  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0786  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04402  acetyltransferase  30.49 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.526099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2585  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000324557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.169215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>