24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3858 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3858  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4558  acetyltransferase  71.92 
 
 
146 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1331  GCN5-related N-acetyltransferase  71.53 
 
 
146 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4065  GCN5-related N-acetyltransferase  70.49 
 
 
122 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3779  GCN5-related N-acetyltransferase  52.63 
 
 
148 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.72634  normal  0.0513749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1599  acetyltransferase, GNAT family  54.03 
 
 
154 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.693259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4348  GCN5-related N-acetyltransferase  49.24 
 
 
139 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3184  GCN5-related N-acetyltransferase  57.76 
 
 
136 aa  116  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.056903  normal  0.102185 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 
145 aa  60.5  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4294  hypothetical protein  30.7 
 
 
148 aa  50.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354309  hitchhiker  0.0000950095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1265  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000595975  hitchhiker  0.00335305 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2715  hypothetical protein  30.33 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000871455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0786  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002161  predicted acyltransferase  33.88 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.839978  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00242  acetyltransferase  32.52 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  25.24 
 
 
128 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000885364  hitchhiker  0.000586382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1479  GCN5-related N-acetyltransferase  40.45 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0715802  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.553749  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1055  hypothetical protein  30.91 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2803  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.409775  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0895  hypothetical protein  31.91 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0940  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>