15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0862 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 145 aa  306  6.999999999999999e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4558  acetyltransferase  34.88 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1331  GCN5-related N-acetyltransferase  34.4 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4065  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3858  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2715  hypothetical protein  29.92 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000871455  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00242  acetyltransferase  30.43 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002161  predicted acyltransferase  31.97 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.839978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4348  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3184  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.056903  normal  0.102185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4294  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354309  hitchhiker  0.0000950095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1599  acetyltransferase, GNAT family  29.51 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.693259  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36534  predicted protein  39.71 
 
 		 430 aa  47.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.472214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3779  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.72634  normal  0.0513749 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3612  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.601769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>