22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1599 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1599  acetyltransferase, GNAT family  100 
 
 		 154 aa  313  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.693259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3779  GCN5-related N-acetyltransferase  81.43 
 
 		 148 aa  228  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.72634  normal  0.0513749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4348  GCN5-related N-acetyltransferase  55.64 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4558  acetyltransferase  57.48 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1331  GCN5-related N-acetyltransferase  57.14 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3858  GCN5-related N-acetyltransferase  54.03 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4065  GCN5-related N-acetyltransferase  57.94 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3184  GCN5-related N-acetyltransferase  55.65 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.056903  normal  0.102185 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  33.01 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000885364  hitchhiker  0.000586382 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  29.51 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2878  hypothetical protein  24.79 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2715  hypothetical protein  27.86 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000871455  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4294  hypothetical protein  28.33 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354309  hitchhiker  0.0000950095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4427  hypothetical protein  30.84 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.499385  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4392  hypothetical protein  30.84 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.72967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4514  hypothetical protein  30.84 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4590  hypothetical protein  29.91 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00242  acetyltransferase  26.72 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002161  predicted acyltransferase  29.73 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.839978  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4517  hypothetical protein  29.91 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0536703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1265  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000595975  hitchhiker  0.00335305 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0786  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>