More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4134 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4134  translation initiation factor IF-1  100 
 
 		 72 aa  145  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.248393  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0680  translation initiation factor IF-1  77.14 
 
 		 72 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2087  translation initiation factor IF-1  75 
 
 		 72 aa  113  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000107784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1578  translation initiation factor IF-1  70.83 
 
 		 73 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000164388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2132  translation initiation factor 1  70.83 
 
 		 73 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0444568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2949  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 		 72 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2132  translation initiation factor IF-1  74.29 
 
 		 72 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01400  translation initiation factor IF-1  72.22 
 
 		 75 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1412  translation initiation factor IF-1  69.44 
 
 		 72 aa  110  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.59758e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1750  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000829048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1837  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3769  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00277571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0729  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0498  translation initiation factor IF-1  72.86 
 
 		 72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2309  translation initiation factor IF-1  70 
 
 		 72 aa  107  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0168  translation initiation factor IF-1  71.43 
 
 		 73 aa  107  5e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000112845  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3614  translation initiation factor 1  72.22 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000124653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3972  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0218  translation initiation factor 1 (bIF-1)  68.57 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1762  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00307993  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2274  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199811  hitchhiker  0.00298742 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2436  translation initiation factor 1  68.57 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3140  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.222249  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2207  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000268658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1912  translation initiation factor IF-1  66.67 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000211647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0134  translation initiation factor IF-1  68.06 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000106677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1285  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 83 aa  104  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1829  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1346  translation initiation factor IF-1  64.79 
 
 		 83 aa  104  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1446  translation initiation factor 1  63.89 
 
 		 72 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.43996  normal  0.245774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2146  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000135511  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0203  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2042  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000556493  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1160  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000283848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0890  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152368  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1399  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1637  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0130  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2160  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1501  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  103  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2056  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  103  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1409  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 77 aa  103  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0978791  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1569  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 77 aa  103  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.471735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0705  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0311  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000252323  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0497  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 73 aa  103  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000154065  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_440  translation initiation factor 1 (IF-1)  65.71 
 
 		 73 aa  103  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000138941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3259  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  103  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.015028  hitchhiker  0.0000000000497253 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0474  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 73 aa  103  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0624  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  103  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2598  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  103  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000268171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2927  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2215  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0331971  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1113  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 72 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000744837  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1857  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  102  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0376  translation initiation factor IF-1  61.43 
 
 		 71 aa  102  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0329  translation initiation factor 1  64.38 
 
 		 73 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208578  decreased coverage  0.000347298 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00888  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2759  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000433006  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1916  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2237  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2765  translation initiation factor IF-1  65.28 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.219281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2445  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00419515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0782  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198783  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1019  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2712  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.18852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0864  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.177716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0987  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1053  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1068  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0959  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0988  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00216132  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1168  translation initiation factor IF-1  62.86 
 
 		 71 aa  102  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0957  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000550237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00895  hypothetical protein  63.89 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.220909  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1722  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935268  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3880  translation initiation factor IF-1  67.65 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2055  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00014827  normal  0.33014 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1046  translation initiation factor IF-1  63.89 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00368143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0133  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000119555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1261  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0133  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000219097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0129  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.6060100000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0127  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000150239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5172  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0133  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000769266  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0307  translation initiation factor IF-1  59.72 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1887  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000185401  hitchhiker  0.0000121311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0146  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02359  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0164  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20640  translation initiation factor 1  65.75 
 
 		 73 aa  101  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.355851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0713  translation initiation factor IF-1  65.71 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2698  translation initiation factor IF-1  61.11 
 
 		 72 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000441165  normal  0.11278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0128  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000687625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2688  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00223234  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2401  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000518496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0127  translation initiation factor IF-1  67.14 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000431634  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1756  translation initiation factor IF-1  62.5 
 
 		 72 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2809  translation initiation factor IF-1  64.29 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371749  hitchhiker  0.00000000419913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>