More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2965 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2965  adenylate kinase  100 
 
 
215 aa  438  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0839  adenylate kinase  64.39 
 
 
218 aa  285  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.257745  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3887  adenylate kinase  62.44 
 
 
228 aa  274  9e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  39.9 
 
 
215 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  39.15 
 
 
217 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  41.63 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  38.03 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  40.72 
 
 
213 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  41.43 
 
 
216 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1912  adenylate kinase  40.2 
 
 
207 aa  168  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.298172  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  37.09 
 
 
214 aa  168  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  41.51 
 
 
216 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1313  adenylate kinase  40.64 
 
 
220 aa  166  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1373  adenylate kinase  40.64 
 
 
220 aa  166  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000458386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  41.23 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  38.21 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0769  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  41.84 
 
 
215 aa  164  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.8085  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  37.32 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  38.54 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1112  adenylate kinase  38.31 
 
 
209 aa  162  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  37.74 
 
 
216 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  37.74 
 
 
216 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  37.32 
 
 
213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  37.74 
 
 
217 aa  161  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  39.8 
 
 
217 aa  161  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  39.18 
 
 
215 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  39.18 
 
 
215 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  40.3 
 
 
214 aa  159  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  40 
 
 
215 aa  158  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  37.8 
 
 
215 aa  158  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  40.72 
 
 
215 aa  158  6e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  39.8 
 
 
214 aa  158  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  37.14 
 
 
214 aa  157  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  35.75 
 
 
226 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  36.67 
 
 
216 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  37.62 
 
 
216 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  37.91 
 
 
208 aa  156  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  35.85 
 
 
216 aa  155  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0419  adenylate kinase  39.32 
 
 
225 aa  155  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  36.2 
 
 
226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  38.28 
 
 
214 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  38.76 
 
 
214 aa  154  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  37.14 
 
 
216 aa  154  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  37.14 
 
 
216 aa  154  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  37.14 
 
 
216 aa  154  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  37.14 
 
 
216 aa  154  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  37.14 
 
 
216 aa  154  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  37.62 
 
 
216 aa  154  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  38.42 
 
 
211 aa  154  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  37.14 
 
 
216 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  37.14 
 
 
216 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  37.14 
 
 
216 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  37.74 
 
 
218 aa  153  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  37.14 
 
 
216 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  37.93 
 
 
217 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  38.92 
 
 
217 aa  152  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2039  Adenylate kinase  39.05 
 
 
214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  39.59 
 
 
211 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1954  Adenylate kinase  39.05 
 
 
214 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  36.89 
 
 
228 aa  149  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  36.92 
 
 
213 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1976  adenylate kinase  40.3 
 
 
215 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  37.14 
 
 
219 aa  149  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  37.19 
 
 
222 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  40 
 
 
224 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23240  Adenylate kinase  39.15 
 
 
208 aa  147  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112414 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2252  adenylate kinase  35.71 
 
 
215 aa  148  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  39.29 
 
 
217 aa  147  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  37.8 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1925  adenylate kinase  37.62 
 
 
214 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  38.42 
 
 
216 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0348  adenylate kinase  35.92 
 
 
218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0290027  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0518  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  35.21 
 
 
220 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  unclonable  0.0000000000175387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  37.07 
 
 
217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  37.07 
 
 
217 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2319  adenylate kinase  34.78 
 
 
217 aa  144  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.383145  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  38.97 
 
 
217 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0286  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  34.93 
 
 
211 aa  144  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000626987  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  37.26 
 
 
213 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  38.39 
 
 
423 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  35.07 
 
 
208 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  35.07 
 
 
219 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3213  adenylate kinase  37.38 
 
 
250 aa  142  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107292  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0010  adenylate kinases  35.11 
 
 
219 aa  142  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  39.13 
 
 
225 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  36.19 
 
 
224 aa  141  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1553  adenylate kinase  35.05 
 
 
218 aa  141  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  36.41 
 
 
220 aa  141  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1886  adenylate kinase  36.32 
 
 
218 aa  141  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  37.5 
 
 
217 aa  141  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09780  Adenylate kinase  38.66 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  37.44 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1736  adenylate kinase  34.6 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.353291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1234  adenylate kinase  39.42 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  36.92 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1932  adenylate kinase  37.44 
 
 
214 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  36.32 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  38.46 
 
 
217 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  34.3 
 
 
219 aa  138  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  34.43 
 
 
216 aa  137  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>