42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0753 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0753  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  151  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03268  hypothetical protein  55.71 
 
 
77 aa  87.8  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1087  hypothetical protein  55.88 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0960  hypothetical protein  52.7 
 
 
75 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0956  hypothetical protein  54.79 
 
 
77 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3298  hypothetical protein  53.12 
 
 
75 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3310  hypothetical protein  53.12 
 
 
75 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0946047  hitchhiker  0.00000513019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3159  hypothetical protein  53.12 
 
 
75 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0989  hypothetical protein  45.95 
 
 
74 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000803888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0459  hypothetical protein  50.72 
 
 
77 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00752  uncharacterized conserved membrane  54.1 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108844  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002714  hypothetical protein  61.54 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2532  hypothetical protein  51.47 
 
 
74 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3096  hypothetical protein  47.76 
 
 
73 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586544  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1877  hypothetical protein  59.62 
 
 
77 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1685  hypothetical protein  50.85 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0956  hypothetical protein  48.65 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0537331  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0931  hypothetical protein  44.59 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.977119  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3359  protein of unknown function DUF539  44.59 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00348618  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3556  hypothetical protein  44.59 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3431  hypothetical protein  44.59 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0177543  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0981  hypothetical protein  44.59 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.294552  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0943  hypothetical protein  44.59 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0945  hypothetical protein  44.59 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0947  hypothetical protein  44.59 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1110  hypothetical protein  44.59 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2874  hypothetical protein  50.88 
 
 
74 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3424  hypothetical protein  46.27 
 
 
73 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3610  hypothetical protein  47.06 
 
 
74 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0940  hypothetical protein  51.67 
 
 
71 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0322153  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0752  hypothetical protein  39.68 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2286  protein of unknown function DUF539  51.85 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0636818  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000683  hypothetical protein  47.27 
 
 
69 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2168  hypothetical protein  55.81 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25370  hypothetical protein  55.81 
 
 
75 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2432  hypothetical protein  39.39 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2111  hypothetical protein  39.39 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3419  hypothetical protein  51.11 
 
 
79 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2383  hypothetical protein  40 
 
 
59 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1718  hypothetical protein  32.79 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580683  normal  0.0217138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1602  hypothetical protein  64.29 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0213591  normal  0.0400272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14660  hypothetical protein  59.38 
 
 
77 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>