12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2383 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2383  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  117  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2286  protein of unknown function DUF539  53.7 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0636818  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03268  hypothetical protein  45.76 
 
 		 77 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0753  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0752  hypothetical protein  56.76 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1685  hypothetical protein  46.15 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0956  hypothetical protein  45 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002714  hypothetical protein  44.23 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2532  hypothetical protein  37.7 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1087  hypothetical protein  37.7 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0989  hypothetical protein  35 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000803888  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1877  hypothetical protein  44.23 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>