41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0956 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0956  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  156  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03268  hypothetical protein  83.12 
 
 
77 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002714  hypothetical protein  83.12 
 
 
77 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1877  hypothetical protein  85.71 
 
 
77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00752  uncharacterized conserved membrane  55.26 
 
 
77 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0459  hypothetical protein  53.95 
 
 
77 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0960  hypothetical protein  51.32 
 
 
75 aa  91.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3298  hypothetical protein  52.11 
 
 
75 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3310  hypothetical protein  52.11 
 
 
75 aa  88.2  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0946047  hitchhiker  0.00000513019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3159  hypothetical protein  52.11 
 
 
75 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0753  hypothetical protein  54.79 
 
 
74 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0989  hypothetical protein  53.95 
 
 
74 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000803888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2532  hypothetical protein  52.63 
 
 
74 aa  84  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1087  hypothetical protein  57.35 
 
 
76 aa  83.6  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0945  hypothetical protein  52.63 
 
 
74 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0947  hypothetical protein  52.63 
 
 
74 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0943  hypothetical protein  52.63 
 
 
74 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0981  hypothetical protein  52.63 
 
 
74 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.294552  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0931  hypothetical protein  51.32 
 
 
74 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.977119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3556  hypothetical protein  51.32 
 
 
74 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3359  protein of unknown function DUF539  51.32 
 
 
74 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00348618  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3431  hypothetical protein  51.32 
 
 
74 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0177543  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1110  hypothetical protein  51.32 
 
 
74 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3096  hypothetical protein  51.32 
 
 
73 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3610  hypothetical protein  52.63 
 
 
74 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0956  hypothetical protein  54.41 
 
 
74 aa  72  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0537331  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2874  hypothetical protein  55.26 
 
 
74 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1685  hypothetical protein  47.46 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3424  hypothetical protein  47.37 
 
 
73 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0752  hypothetical protein  44.78 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0940  hypothetical protein  45.45 
 
 
71 aa  62  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0322153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2286  protein of unknown function DUF539  54.39 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0636818  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000683  hypothetical protein  48.15 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3419  hypothetical protein  41.43 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2168  hypothetical protein  45.45 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2383  hypothetical protein  45 
 
 
59 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25370  hypothetical protein  45.45 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2432  hypothetical protein  35.82 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0091  hypothetical protein  34.78 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2111  hypothetical protein  35.82 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1718  hypothetical protein  36.96 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580683  normal  0.0217138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>