41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3424 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3424  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  146  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3096  hypothetical protein  84.93 
 
 		 73 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2532  hypothetical protein  78.38 
 
 		 74 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0989  hypothetical protein  77.03 
 
 		 74 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000803888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3610  hypothetical protein  90.54 
 
 		 74 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0947  hypothetical protein  78.38 
 
 		 74 aa  103  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0943  hypothetical protein  78.38 
 
 		 74 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0981  hypothetical protein  78.38 
 
 		 74 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.294552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0945  hypothetical protein  78.38 
 
 		 74 aa  103  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1110  hypothetical protein  77.03 
 
 		 74 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3359  protein of unknown function DUF539  75.68 
 
 		 74 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00348618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3431  hypothetical protein  75.68 
 
 		 74 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0177543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0931  hypothetical protein  75.68 
 
 		 74 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.977119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3556  hypothetical protein  75.68 
 
 		 74 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2874  hypothetical protein  83.78 
 
 		 74 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0956  hypothetical protein  77.03 
 
 		 74 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0537331  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0459  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00752  uncharacterized conserved membrane  55.84 
 
 		 77 aa  88.2  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108844  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3159  hypothetical protein  54.05 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3298  hypothetical protein  54.05 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3310  hypothetical protein  54.05 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0946047  hitchhiker  0.00000513019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0960  hypothetical protein  47.3 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0956  hypothetical protein  47.37 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03268  hypothetical protein  46.05 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1685  hypothetical protein  47.62 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0753  hypothetical protein  46.27 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002714  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1087  hypothetical protein  41.67 
 
 		 76 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1877  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0940  hypothetical protein  37.5 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0322153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2286  protein of unknown function DUF539  41.54 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0636818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2168  hypothetical protein  41.43 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25370  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0752  hypothetical protein  34.33 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1718  hypothetical protein  47.83 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580683  normal  0.0217138 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2432  hypothetical protein  44.83 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000683  hypothetical protein  33.87 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2111  hypothetical protein  44.83 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2383  hypothetical protein  33.87 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0091  hypothetical protein  38.6 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1804  hypothetical protein  35.71 
 
 		 89 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>