41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1877 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1877  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03268  hypothetical protein  88.31 
 
 		 77 aa  140  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0956  hypothetical protein  85.71 
 
 		 77 aa  139  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002714  hypothetical protein  89.61 
 
 		 77 aa  117  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00752  uncharacterized conserved membrane  56.58 
 
 		 77 aa  104  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0459  hypothetical protein  52.63 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3310  hypothetical protein  56.34 
 
 		 75 aa  93.6  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0946047  hitchhiker  0.00000513019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3159  hypothetical protein  56.34 
 
 		 75 aa  93.6  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3298  hypothetical protein  56.34 
 
 		 75 aa  93.6  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1087  hypothetical protein  63.24 
 
 		 76 aa  90.9  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0960  hypothetical protein  51.32 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0753  hypothetical protein  54.29 
 
 		 74 aa  83.6  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0989  hypothetical protein  51.32 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000803888  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0943  hypothetical protein  51.32 
 
 		 74 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0945  hypothetical protein  51.32 
 
 		 74 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2532  hypothetical protein  48.68 
 
 		 74 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0947  hypothetical protein  51.32 
 
 		 74 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0981  hypothetical protein  51.32 
 
 		 74 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.294552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3556  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0931  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.977119  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3359  protein of unknown function DUF539  50 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00348618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3431  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0177543  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1110  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3096  hypothetical protein  47.37 
 
 		 73 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0956  hypothetical protein  51.47 
 
 		 74 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0537331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3610  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2874  hypothetical protein  52.63 
 
 		 74 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3424  hypothetical protein  47.37 
 
 		 73 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1685  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0752  hypothetical protein  44.78 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2286  protein of unknown function DUF539  50.75 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0636818  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000683  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0940  hypothetical protein  43.64 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0322153  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3419  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2383  hypothetical protein  44.26 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1718  hypothetical protein  45.65 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580683  normal  0.0217138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2168  hypothetical protein  45.45 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25370  hypothetical protein  45.45 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2432  hypothetical protein  33.82 
 
 		 81 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2111  hypothetical protein  33.82 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1924  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>