22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3419 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3419  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03268  hypothetical protein  48.89 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1877  hypothetical protein  51.11 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002714  hypothetical protein  48.89 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0956  hypothetical protein  41.43 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0459  hypothetical protein  38.46 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0753  hypothetical protein  51.11 
 
 		 74 aa  48.9  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1087  hypothetical protein  39.34 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00752  uncharacterized conserved membrane  36.71 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108844  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0752  hypothetical protein  48.89 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1685  hypothetical protein  37.88 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2168  hypothetical protein  38.78 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3159  hypothetical protein  34.78 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3310  hypothetical protein  34.78 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0946047  hitchhiker  0.00000513019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3298  hypothetical protein  34.78 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25370  hypothetical protein  38.78 
 
 		 75 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000683  hypothetical protein  40.35 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0989  hypothetical protein  30.77 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000803888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2532  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0940  hypothetical protein  44.19 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0322153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2286  protein of unknown function DUF539  37.68 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0636818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>