41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1602 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1602  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  153  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0213591  normal  0.0400272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25370  hypothetical protein  76.32 
 
 		 75 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2168  hypothetical protein  76.32 
 
 		 75 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14660  hypothetical protein  67.11 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1718  hypothetical protein  48.68 
 
 		 77 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580683  normal  0.0217138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1924  hypothetical protein  60.66 
 
 		 80 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1576  hypothetical protein  47.56 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0731639  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1804  hypothetical protein  45.71 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0940  hypothetical protein  43.08 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0322153  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0091  hypothetical protein  37.5 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1087  hypothetical protein  43.48 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0753  hypothetical protein  41.18 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2286  protein of unknown function DUF539  45.45 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0636818  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2111  hypothetical protein  37.29 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0956  hypothetical protein  52.27 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2432  hypothetical protein  37.29 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03268  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0752  hypothetical protein  51.11 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002714  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1685  hypothetical protein  51.16 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2532  hypothetical protein  45.45 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0459  hypothetical protein  46.51 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3096  hypothetical protein  45.45 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586544  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1877  hypothetical protein  47.73 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0989  hypothetical protein  35.21 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000803888  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00752  uncharacterized conserved membrane  46.51 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108844  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000683  hypothetical protein  42.22 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0960  hypothetical protein  45.24 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0947  hypothetical protein  38.46 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0945  hypothetical protein  38.46 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0981  hypothetical protein  38.46 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.294552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0943  hypothetical protein  38.46 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1110  hypothetical protein  45.45 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3556  hypothetical protein  36.92 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3431  hypothetical protein  36.92 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0177543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0931  hypothetical protein  36.92 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.977119  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3359  protein of unknown function DUF539  36.92 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00348618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3159  hypothetical protein  45.24 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3310  hypothetical protein  45.24 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0946047  hitchhiker  0.00000513019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3298  hypothetical protein  45.24 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3610  hypothetical protein  41.79 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>