268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2936 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2936  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
384 aa  783    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.175717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.09 
 
 
432 aa  347  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764264  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1618  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.03 
 
 
306 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1789  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.29 
 
 
271 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3677  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.05 
 
 
261 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1732  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.63 
 
 
270 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3773  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.7 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.884647  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1189  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.59 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01870  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.29 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2523  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.35 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0984  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.81 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2837  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.35 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2869  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.8 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0737  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.87 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1327  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.65 
 
 
278 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868448  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0473  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.15 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0590188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2305  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.36 
 
 
288 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.537495  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1554  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.22 
 
 
271 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000775379  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_839  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.11 
 
 
260 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00921901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4475  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.14 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00262186  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0923  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.51 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.532012  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0857  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.66 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2962  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.75 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_002936  DET0966  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.66 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00202083  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3817  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.52 
 
 
305 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311868  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0486  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.03 
 
 
261 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0785  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.59 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.577083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.59 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C63  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.45 
 
 
268 aa  65.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3064  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.83 
 
 
865 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333242  normal  0.223199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4345  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.15 
 
 
285 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.19 
 
 
263 aa  62.8  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0760049  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2010  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.53 
 
 
294 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1209  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.44 
 
 
266 aa  62.8  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0951  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.55 
 
 
276 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3048  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.83 
 
 
954 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.814492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3107  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.83 
 
 
954 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.851617  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2313  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.11 
 
 
294 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2944  Prolipoprotein diacylglyceryltransferase-like protein  25.94 
 
 
372 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0870252  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.59 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.35 
 
 
270 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.57 
 
 
281 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0181566  normal  0.0698787 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.18 
 
 
261 aa  58.9  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.875971  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0703  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  22.69 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.609213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2945  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25 
 
 
585 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.214407  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1342  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  22.69 
 
 
294 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.69 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.27 
 
 
314 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.86 
 
 
273 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0905  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.53 
 
 
267 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.24 
 
 
279 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4492  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.86 
 
 
321 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0357938  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0661  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.59 
 
 
295 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1088  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.9 
 
 
281 aa  57.4  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.626064  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  21.32 
 
 
302 aa  57  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.863429  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  22.82 
 
 
266 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2819  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.05 
 
 
820 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200403  normal  0.775609 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.56 
 
 
260 aa  57  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.18 
 
 
267 aa  56.6  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  21.57 
 
 
291 aa  57  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  22.82 
 
 
266 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1116  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.33 
 
 
249 aa  56.6  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.116 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0191  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.54 
 
 
277 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.95258  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0273  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.54 
 
 
277 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.14 
 
 
301 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.42 
 
 
271 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3170  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.27 
 
 
372 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.22 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0462  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25 
 
 
342 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.285848  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1139  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.38 
 
 
282 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1235  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.8 
 
 
269 aa  55.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2330  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  21.43 
 
 
292 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.486837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.51 
 
 
257 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.22 
 
 
285 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.55 
 
 
271 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.89 
 
 
297 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1265  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.03 
 
 
305 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.9 
 
 
271 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0429  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.88 
 
 
279 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.28 
 
 
260 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.58 
 
 
300 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1966  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.09 
 
 
303 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.52168 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1308  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.53 
 
 
300 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5705  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.31 
 
 
388 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.74 
 
 
301 aa  53.1  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.642612  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0994  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.84 
 
 
285 aa  53.1  0.000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.101042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.13 
 
 
287 aa  52.8  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1391  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  20.31 
 
 
284 aa  53.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171853  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14920  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4840  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.43 
 
 
270 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.08 
 
 
271 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.42 
 
 
283 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2870  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.68 
 
 
498 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00175644  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.11 
 
 
273 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3170  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.64 
 
 
270 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1349  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.11 
 
 
282 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.29 
 
 
280 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28080  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  22.98 
 
 
354 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.640026  normal  0.438535 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1408  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.69 
 
 
289 aa  51.6  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.997076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  23.98 
 
 
280 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>