More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1966 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1966  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
303 aa  604  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.52168 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.63 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1265  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.33 
 
 
305 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2069  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.73 
 
 
257 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000677833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0461  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.79 
 
 
264 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142077  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4345  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.27 
 
 
285 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3170  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.97 
 
 
270 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.21 
 
 
270 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3705  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.81 
 
 
270 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1192  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.98 
 
 
279 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5266  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.96 
 
 
270 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4855  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.96 
 
 
270 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1967  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.09 
 
 
282 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.394112  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1165  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.98 
 
 
279 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5247  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.96 
 
 
270 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5011  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.96 
 
 
270 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5391  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.96 
 
 
270 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.59 
 
 
270 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5281  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.84 
 
 
270 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4955  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.17 
 
 
270 aa  99.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4840  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.59 
 
 
270 aa  99.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1230  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.44 
 
 
289 aa  99  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0607531 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.92 
 
 
360 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1732  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.28 
 
 
270 aa  96.3  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05241  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.63 
 
 
297 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0904  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35 
 
 
293 aa  94.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1736  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.54 
 
 
280 aa  94  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0556739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2986  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29 
 
 
269 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0528161  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1279  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.29 
 
 
250 aa  92.8  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1227  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.64 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0136152 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05161  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.35 
 
 
297 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04851  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.7 
 
 
297 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.05 
 
 
257 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.24 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0905  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.3 
 
 
267 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.76 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.52 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.1 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04611  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.12 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.93 
 
 
301 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.24 
 
 
301 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.15 
 
 
265 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.1 
 
 
289 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0785  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.5 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.577083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.5 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.57 
 
 
290 aa  89  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1792  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.32 
 
 
303 aa  89  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05151  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.32 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.404739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.33 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.57 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00174418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0863  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.57 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00349665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02637  hypothetical protein  27.57 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3034  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.57 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0527385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.57 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2585  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.43 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.221457  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2975  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.57 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00678242  normal  0.0109979 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3148  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.57 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000698602  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.57 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.115465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0887  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.57 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.82 
 
 
287 aa  87  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06631  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.24 
 
 
304 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.58 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1189  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.73 
 
 
258 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0984  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.34 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0626  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.25 
 
 
292 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1554  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.58 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000775379  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2330  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.67 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.486837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0462  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.03 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.285848  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.38 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0473  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.54 
 
 
357 aa  84  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0590188  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.54 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.78 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.7 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.04 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0760049  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2010  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.03 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2869  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.05 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09840  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.45 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1450  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.16 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.16 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.642612  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.09 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.57 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.57 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.57 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2864  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.87 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.12 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.27 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.27 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0627  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.72 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616827  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.88 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2481  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.76 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.148056  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0703  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.01 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.609213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.3 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1342  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.35 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0047  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.42 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000638304  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0046  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3270  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.57 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1116  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  24.83 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.62 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1101  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.34 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>