More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2945 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2945  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
585 aa  1147    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.214407  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3048  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  68.93 
 
 
954 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.814492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3107  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  68.93 
 
 
954 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.851617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2819  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  69.64 
 
 
820 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200403  normal  0.775609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3064  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  68.93 
 
 
865 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333242  normal  0.223199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3597  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  71.43 
 
 
767 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136017  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2491  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  67.27 
 
 
344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4475  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  68.57 
 
 
345 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00262186  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11630  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  67.63 
 
 
468 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.102821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5699  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.23 
 
 
371 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116082  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28080  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.42 
 
 
354 aa  354  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.640026  normal  0.438535 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60 
 
 
323 aa  333  4e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2870  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.18 
 
 
498 aa  324  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00175644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2944  Prolipoprotein diacylglyceryltransferase-like protein  56.94 
 
 
372 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0870252  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1455  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.04 
 
 
322 aa  311  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3073  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.55 
 
 
347 aa  306  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171179  hitchhiker  0.000454743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5705  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.19 
 
 
388 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2218  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.7 
 
 
354 aa  292  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.09 
 
 
325 aa  289  8e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.14446  normal  0.252754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2569  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.46 
 
 
295 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000200473  hitchhiker  0.00320491 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1218  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.21 
 
 
285 aa  284  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3340  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.15 
 
 
301 aa  276  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469594  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2962  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.85 
 
 
334 aa  276  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1502  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.97 
 
 
303 aa  269  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3169  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.69 
 
 
378 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.131558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3170  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.65 
 
 
372 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129029  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1076  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.98 
 
 
333 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0236556  normal  0.51143 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4457  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.98 
 
 
319 aa  262  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0207952  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12920  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.93 
 
 
290 aa  261  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.870796  normal  0.137466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3394  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.4 
 
 
390 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.93 
 
 
292 aa  259  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.77 
 
 
314 aa  256  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1169  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.86 
 
 
356 aa  252  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.760314  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.06 
 
 
409 aa  252  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
327 aa  245  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.175815  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1685  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.66 
 
 
396 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000186875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1690  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.92 
 
 
409 aa  240  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268506  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4470  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.12 
 
 
293 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.12 
 
 
293 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693008  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4201  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.12 
 
 
293 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2513  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.73 
 
 
362 aa  237  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0462  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.08 
 
 
342 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.285848  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1934  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.4 
 
 
387 aa  217  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0138413  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0804  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.22 
 
 
305 aa  212  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0481  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.13 
 
 
315 aa  209  8e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.04165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0626  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.04 
 
 
327 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467167  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14920  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.36 
 
 
307 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1139  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.7 
 
 
282 aa  171  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0984  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.95 
 
 
320 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.16 
 
 
276 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0473  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.53 
 
 
357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0590188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4306  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.84 
 
 
290 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1279  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.46 
 
 
250 aa  126  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0737  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.84 
 
 
257 aa  124  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0909  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.42 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.173456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.55 
 
 
299 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2585  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.66 
 
 
293 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.221457  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1554  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.82 
 
 
271 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000775379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4345  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.98 
 
 
285 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2716  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.47 
 
 
251 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1967  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.68 
 
 
282 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.394112  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4955  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.87 
 
 
270 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.03 
 
 
263 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0760049  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.51 
 
 
279 aa  117  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0785  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.51 
 
 
279 aa  117  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.577083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5281  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.87 
 
 
270 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4855  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.47 
 
 
270 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.87 
 
 
270 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5266  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.47 
 
 
270 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5011  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.47 
 
 
270 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4840  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.47 
 
 
270 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5247  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.47 
 
 
270 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5391  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.47 
 
 
270 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04851  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.09 
 
 
297 aa  115  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.82 
 
 
297 aa  114  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0904  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.79 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.06 
 
 
270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1792  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.42 
 
 
303 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2864  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.47 
 
 
305 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0790  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.67 
 
 
293 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.62 
 
 
297 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.337573  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05151  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.42 
 
 
303 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.404739 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0767  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.67 
 
 
293 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05241  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.73 
 
 
297 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1192  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.06 
 
 
279 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1165  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.06 
 
 
279 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1408  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.91 
 
 
289 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.997076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1553  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.72 
 
 
288 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.880731 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06631  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.21 
 
 
304 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3705  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.06 
 
 
270 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05161  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.59 
 
 
297 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3170  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.83 
 
 
270 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2986  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.25 
 
 
269 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0528161  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04611  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.48 
 
 
303 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0370  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.98 
 
 
275 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0626  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
292 aa  102  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09840  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.5 
 
 
284 aa  100  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1736  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.11 
 
 
280 aa  99  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0556739  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0191  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.53 
 
 
277 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.95258  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0273  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.53 
 
 
277 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>