34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1657 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1657  hypothetical protein  100 
 
 
504 aa  1025    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.356019  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1985  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.22 
 
 
521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.225139  hitchhiker  0.0000175467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3149  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.02 
 
 
504 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3292  Redoxin domain protein  28.44 
 
 
453 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000783621  hitchhiker  0.000211392 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0107  Redoxin domain protein  26.09 
 
 
455 aa  57.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1834  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.42 
 
 
381 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2106  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.07 
 
 
367 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0273  Redoxin domain protein  27.44 
 
 
379 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.443578  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2877  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.52 
 
 
376 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  29.17 
 
 
433 aa  53.5  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3993  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
378 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0802  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
164 aa  51.2  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5749  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.88 
 
 
380 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.566272  normal  0.459715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6429  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.45 
 
 
715 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0633633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2725  Redoxin domain protein  25 
 
 
168 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.810606  normal  0.107298 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.19 
 
 
455 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.14 
 
 
288 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1833  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.05 
 
 
360 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1863  Redoxin domain protein  23.74 
 
 
409 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269933  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4526  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.58 
 
 
377 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75  normal  0.0257072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1448  thioredoxin family protein  27.78 
 
 
390 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00492149  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4777  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.67 
 
 
378 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1793  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  29.82 
 
 
188 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5957  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.21 
 
 
378 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131947  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2112  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.84 
 
 
376 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278161  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2065  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.12 
 
 
484 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0452  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.27 
 
 
381 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0250158  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2523  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.96 
 
 
369 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.434668  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13208  thiol:disulfide interchange protein  24.42 
 
 
369 aa  43.5  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.281994  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3227  redoxin family protein  29.69 
 
 
297 aa  43.5  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2011  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.89 
 
 
378 aa  43.5  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02625  hypothetical protein  26.45 
 
 
466 aa  43.5  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  31.58 
 
 
447 aa  43.5  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.53 
 
 
375 aa  43.5  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>