More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0548 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0548  ATPase  100 
 
 		 279 aa  570  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1191  ATPase  83.09 
 
 		 279 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2653  AAA family ATPase  82.67 
 
 		 279 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1311  ATPase  82.67 
 
 		 279 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1883  putative clpA/clpB family protein  81 
 
 		 280 aa  472  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406023  normal  0.307774 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0894  ATPase  80.29 
 
 		 279 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2682  AAA_5 ATPase  79.21 
 
 		 285 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0320361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5168  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  77.42 
 
 		 283 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4631  ATPase central domain-containing protein  77.06 
 
 		 283 aa  448  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1940  ATPase central domain-containing protein  75.36 
 
 		 283 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5094  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  76.7 
 
 		 283 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4254  ATPase protein  76.09 
 
 		 288 aa  441  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6213  ATPase  75.54 
 
 		 281 aa  434  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7091  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  75.54 
 
 		 281 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4638  ATPase  73.93 
 
 		 281 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.10339 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1023  AAA ATPase, central region:ATPase  71.79 
 
 		 295 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58673  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1385  AAA ATPase central domain protein  72.5 
 
 		 283 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0998  hypothetical protein  72.04 
 
 		 290 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0986  ATPase  71.07 
 
 		 292 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0517  AAA ATPase, central region:ATPase  70.61 
 
 		 301 aa  411  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0929  AAA ATPase central domain protein  70.61 
 
 		 293 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  0.607082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0864  AAA ATPase central domain protein  70.32 
 
 		 297 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125814  normal  0.499704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32860  ATPase, AAA family protein  71.22 
 
 		 281 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1639  ATPase  69.53 
 
 		 281 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.435495  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02167  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  70.14 
 
 		 278 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2516  ATPase  68.71 
 
 		 278 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.352302  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1094  ATPase, AAA family protein  69.72 
 
 		 284 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1408  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.74 
 
 		 282 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6260  ATPase  72.04 
 
 		 280 aa  400  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2101  ATPase  71.79 
 
 		 280 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3462  ATPase  72.4 
 
 		 280 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0889695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1977  ATPase  72.73 
 
 		 294 aa  401  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1016  ATPase, AAA family protein  72.86 
 
 		 280 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0299  ATPase, AAA family protein  72.86 
 
 		 280 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3984  hypothetical protein  67.63 
 
 		 281 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3556  ATPase central domain-containing protein  68.21 
 
 		 280 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.187416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.86 
 
 		 280 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2122  ATPase  72.04 
 
 		 280 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787616  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29130  ATPase  67.99 
 
 		 281 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1605  ATPase central domain-containing protein  67.74 
 
 		 280 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.863754  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0906  ATPase  68.46 
 
 		 289 aa  400  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.166593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1178  AAA family ATPase  72.86 
 
 		 280 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2541  ATPase  71.43 
 
 		 281 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104036  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.74 
 
 		 282 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2058  ATPase  65.7 
 
 		 277 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4138  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.68 
 
 		 280 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3298  hypothetical protein  68.71 
 
 		 281 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0860  ATPase  68.21 
 
 		 280 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1936  ATPase, AAA family protein  72.86 
 
 		 317 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576346  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3155  ATPase  67.25 
 
 		 284 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1170  AAA family ATPase  72.5 
 
 		 280 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1331  ATPase, AAA family protein  72.5 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00666024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3952  ATPase central domain-containing protein  67.96 
 
 		 284 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0965  ATPase, AAA family protein  72.14 
 
 		 335 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1910  ATPase  71.33 
 
 		 280 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3873  ATPase  67.63 
 
 		 281 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0352016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1788  ATPase  66.91 
 
 		 281 aa  394  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0849  ATPase, AAA family protein  72.86 
 
 		 317 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4467  AAA ATPase central domain protein  68.66 
 
 		 284 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179152  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4573  AAA family ATPase  67.27 
 
 		 281 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0238067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3905  ATPase, AAA family  67.27 
 
 		 281 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.595065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1580  AAA ATPase, central region:AAA ATPase, central region  67.27 
 
 		 281 aa  390  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.261649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.71 
 
 		 280 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1409  ATPase  66.91 
 
 		 281 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1661  ATPase  67.25 
 
 		 284 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4094  ATPase  67.27 
 
 		 281 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.271648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1316  ATPase  67.27 
 
 		 281 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3315  putative ATPase, AAA family protein  69.64 
 
 		 280 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1719  ATPase central domain-containing protein  64.75 
 
 		 290 aa  386  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0945  ATPase  70.36 
 
 		 280 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2357  ATPase  64.79 
 
 		 284 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.797893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2251  ATPase  69.29 
 
 		 280 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2332  ATPase  69.29 
 
 		 286 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2090  ATPase AAA_5  68.71 
 
 		 281 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0794647  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2355  ATPase central domain-containing protein  69.29 
 
 		 286 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1720  ATPase  69.29 
 
 		 286 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.501312  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2371  ATPase  69.29 
 
 		 280 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5674  AAA ATPase  68.93 
 
 		 280 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2894  ATPase  68.71 
 
 		 289 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220244  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2638  ATPase  69.53 
 
 		 281 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0809  ATPase  63.31 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652104  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0802  AAA family ATPase  61.65 
 
 		 284 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1589  AAA_5 ATPase  67.25 
 
 		 284 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.566046  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1222  ATPase  66.2 
 
 		 286 aa  364  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5020  AAA ATPase central domain protein  59.62 
 
 		 278 aa  306  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.422648  normal  0.019419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0108  ATPase  57.79 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0213616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2134  ATPase  54.85 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00244059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3608  AAA ATPase central domain protein  54.81 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2236  ATPase central domain-containing protein  49.44 
 
 		 279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0437  MoxR-like ATPases  48.33 
 
 		 280 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.405282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0047  ATPase central domain-containing protein  44.74 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2767  ATPase  44.09 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1615  ATPase  42.49 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0936  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  76.19 
 
 		 154 aa  202  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1430  ATPase  41.69 
 
 		 345 aa  202  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3717  ATPase-like protein  44.31 
 
 		 331 aa  198  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2505  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.22 
 
 		 315 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2067  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.75 
 
 		 318 aa  169  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0586  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.71 
 
 		 324 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2060  ATPase-like protein  39.62 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.598093  normal  0.848837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>