More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4254 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4254  ATPase protein  100 
 
 		 288 aa  586  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0894  ATPase  78.18 
 
 		 279 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2653  AAA family ATPase  76.26 
 
 		 279 aa  447  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2682  AAA_5 ATPase  79.27 
 
 		 285 aa  450  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0320361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1311  ATPase  76.26 
 
 		 279 aa  447  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1883  putative clpA/clpB family protein  78.91 
 
 		 280 aa  450  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406023  normal  0.307774 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1191  ATPase  75.18 
 
 		 279 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0548  ATPase  76.09 
 
 		 279 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4631  ATPase central domain-containing protein  75.63 
 
 		 283 aa  434  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5168  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  75.63 
 
 		 283 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5094  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  75.27 
 
 		 283 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1940  ATPase central domain-containing protein  74.82 
 
 		 283 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4638  ATPase  75.18 
 
 		 281 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.10339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7091  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  73.48 
 
 		 281 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6213  ATPase  73.12 
 
 		 281 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3462  ATPase  74.46 
 
 		 280 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0889695  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0998  hypothetical protein  71.84 
 
 		 290 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1910  ATPase  73.74 
 
 		 280 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1023  AAA ATPase, central region:ATPase  71.58 
 
 		 295 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02167  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  70.29 
 
 		 278 aa  408  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6260  ATPase  73.02 
 
 		 280 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1605  ATPase central domain-containing protein  70.4 
 
 		 280 aa  408  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.863754  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1385  AAA ATPase central domain protein  70.36 
 
 		 283 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0986  ATPase  71.01 
 
 		 292 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4138  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  73.38 
 
 		 280 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18588  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0517  AAA ATPase, central region:ATPase  68.23 
 
 		 301 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0929  AAA ATPase central domain protein  69.93 
 
 		 293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  0.607082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2122  ATPase  72.66 
 
 		 280 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787616  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0864  AAA ATPase central domain protein  69.4 
 
 		 297 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125814  normal  0.499704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2541  ATPase  71.22 
 
 		 281 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104036  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2894  ATPase  70.24 
 
 		 289 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220244  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2516  ATPase  68.48 
 
 		 278 aa  401  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.352302  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1977  ATPase  72.2 
 
 		 294 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3298  hypothetical protein  69.45 
 
 		 281 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0906  ATPase  69.68 
 
 		 289 aa  400  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.166593  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1639  ATPase  68.93 
 
 		 281 aa  397  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.435495  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29130  ATPase  68.95 
 
 		 281 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3873  ATPase  68.59 
 
 		 281 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0352016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32860  ATPase, AAA family protein  70.4 
 
 		 281 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3984  hypothetical protein  68.59 
 
 		 281 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4573  AAA family ATPase  68.23 
 
 		 281 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0238067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3905  ATPase, AAA family  67.87 
 
 		 281 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.595065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1580  AAA ATPase, central region:AAA ATPase, central region  67.87 
 
 		 281 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.261649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4094  ATPase  68.23 
 
 		 281 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.271648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1178  AAA family ATPase  71.22 
 
 		 280 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1316  ATPase  68.23 
 
 		 281 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2058  ATPase  65.22 
 
 		 277 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.19 
 
 		 280 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1936  ATPase, AAA family protein  70.71 
 
 		 317 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0299  ATPase, AAA family protein  70.86 
 
 		 280 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1016  ATPase, AAA family protein  70.86 
 
 		 280 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1331  ATPase, AAA family protein  70.36 
 
 		 317 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00666024  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1409  ATPase  66.9 
 
 		 281 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0849  ATPase, AAA family protein  70.71 
 
 		 317 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3556  ATPase central domain-containing protein  66.55 
 
 		 280 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.187416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0965  ATPase, AAA family protein  70.36 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1788  ATPase  67.51 
 
 		 281 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3155  ATPase  67.73 
 
 		 284 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1170  AAA family ATPase  70.86 
 
 		 280 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.42 
 
 		 280 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1094  ATPase, AAA family protein  67.73 
 
 		 284 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2090  ATPase AAA_5  68.57 
 
 		 281 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0794647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3315  putative ATPase, AAA family protein  68.35 
 
 		 280 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2101  ATPase  69.06 
 
 		 280 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0860  ATPase  66.55 
 
 		 280 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4467  AAA ATPase central domain protein  66.31 
 
 		 284 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179152  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2357  ATPase  65.25 
 
 		 284 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.797893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3952  ATPase central domain-containing protein  65.96 
 
 		 284 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2251  ATPase  68.82 
 
 		 280 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1408  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  68.03 
 
 		 282 aa  377  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1719  ATPase central domain-containing protein  64.39 
 
 		 290 aa  377  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2638  ATPase  70 
 
 		 281 aa  378  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1661  ATPase  64.54 
 
 		 284 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0945  ATPase  69.18 
 
 		 280 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0809  ATPase  64.03 
 
 		 284 aa  376  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652104  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  68.03 
 
 		 282 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2371  ATPase  68.82 
 
 		 280 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2355  ATPase central domain-containing protein  67.97 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0802  AAA family ATPase  63.31 
 
 		 284 aa  374  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2332  ATPase  67.97 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5674  AAA ATPase  67.27 
 
 		 280 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1720  ATPase  67.97 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.501312  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1222  ATPase  64.89 
 
 		 286 aa  362  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1589  AAA_5 ATPase  63.96 
 
 		 284 aa  358  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.566046  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2134  ATPase  57.25 
 
 		 291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00244059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0108  ATPase  56.72 
 
 		 292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0213616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5020  AAA ATPase central domain protein  59.09 
 
 		 278 aa  301  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.422648  normal  0.019419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3608  AAA ATPase central domain protein  56.13 
 
 		 289 aa  298  7e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0437  MoxR-like ATPases  48.7 
 
 		 280 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.405282  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2236  ATPase central domain-containing protein  46.84 
 
 		 279 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0047  ATPase central domain-containing protein  45.76 
 
 		 281 aa  245  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2767  ATPase  47.04 
 
 		 311 aa  214  9e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1430  ATPase  41.97 
 
 		 345 aa  202  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1615  ATPase  42.65 
 
 		 308 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0936  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  75.4 
 
 		 154 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3717  ATPase-like protein  45.35 
 
 		 331 aa  195  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2505  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.94 
 
 		 315 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0586  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.93 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2067  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.36 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1601  AAA ATPase  46.79 
 
 		 335 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>