50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2617 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2617  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0865  multiple resistance and pH regulation protein F  36.9 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.717084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2097  multiple resistance and pH regulation protein F  41.77 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0612  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  46.27 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.716984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3690  multiple resistance and pH regulation protein F  41.38 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0879  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  50 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00982664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  48.05 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000446715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1279  Na+/H+ antiporter  42.42 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.981373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1773  multiple resistance and pH regulation protein F  43.04 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0869  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  40.28 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0662572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1747  multiple resistance and pH regulation protein F  31.58 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2853  multiple resistance and pH regulation protein F  38.24 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2714  multiple resistance and pH regulation protein F  38.33 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2339  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  41.79 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.962701  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36.84 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1211  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  39.02 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0665  multiple resistance and pH regulation protein F  35.71 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3986  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.91 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0733  multiple resistance and pH regulation protein F  39.73 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19570  sodium hydrogen antiporter subunitF, ShaF  40.32 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0385  multiple resistance and pH regulation protein F  36.92 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0828098  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0099  multiple resistance and pH regulation protein F  32.56 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1125  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.88 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000095206  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0405  hypothetical protein  32.79 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0059  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36.76 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1770  Na(+)/H(+) antiporter subunit F  32.79 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0565  multiple resistance and pH regulation protein F  37.5 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.4041  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.4 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1682  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  39.71 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.145705  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2932  multiple resistance and pH regulation protein F  40.62 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2215  multiple resistance and pH regulation protein F  40.32 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688335 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3719  multiple resistance and pH regulation protein F  34.67 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1612  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36.84 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000561435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1587  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.23 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1108  multiple resistance and pH regulation protein F  41.94 
 
 		 139 aa  42  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2860  multiple resistance and pH regulation protein F  34.78 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3946  multiple resistance and pH regulation protein F  39.68 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109243 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0034  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.82 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1104  multiple resistance and pH regulation protein F  36.07 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0102977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2523  multiple resistance and pH regulation protein F  28.99 
 
 		 91 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1354  monovalent cation/proton antiporter, pH regulation subunit F  35.94 
 
 		 89 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0079  multiple resistance and pH regulation protein F  33.33 
 
 		 91 aa  40.8  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2810  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  29.17 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0488  multiple resistance and pH regulation protein F  38.33 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.675094 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3809  multiple resistance and pH regulation protein F  40.62 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.332403 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0982  multiple resistance and pH regulation protein F  36.84 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.739743  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1917  multiple resistance and pH regulation protein F  37.93 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.851543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000414  Na(+) H(+) antiporter subunit F  31.82 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3223  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.09 
 
 		 91 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0578  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.81 
 
 		 89 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00573992  decreased coverage  0.00947424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>