More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4078 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_4078  serine O-acetyltransferase  100 
 
 
259 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00201  serine acetyltransferase  68.36 
 
 
268 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.956846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0438  serine O-acetyltransferase  61.24 
 
 
266 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4170  Serine O-acetyltransferase  60.85 
 
 
263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0128  serine acetyltransferase  57.2 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25771  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3299  serine acetyltransferase  57.14 
 
 
260 aa  301  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800758  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4814  serine acetyltransferase  58.4 
 
 
273 aa  301  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3898  serine acetyltransferase  56.8 
 
 
273 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4085  serine acetyltransferase  56.8 
 
 
273 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3917  serine acetyltransferase  56.8 
 
 
273 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4024  serine acetyltransferase  56.8 
 
 
273 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3979  serine acetyltransferase  56.8 
 
 
273 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.423159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03465  serine acetyltransferase  56.8 
 
 
273 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0098  serine O-acetyltransferase  56.8 
 
 
273 aa  300  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4035  serine acetyltransferase  56.8 
 
 
273 aa  300  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03416  hypothetical protein  56.8 
 
 
273 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4111  serine acetyltransferase  56.8 
 
 
273 aa  300  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3819  serine acetyltransferase  56.8 
 
 
273 aa  300  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0101  serine acetyltransferase  56.8 
 
 
273 aa  300  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4980  serine acetyltransferase  56.8 
 
 
273 aa  300  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3944  serine acetyltransferase  56.8 
 
 
273 aa  300  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.863552 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0154  serine acetyltransferase  54.44 
 
 
265 aa  297  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0074  serine acetyltransferase  55.6 
 
 
274 aa  296  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0181  serine acetyltransferase  55.42 
 
 
273 aa  295  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0080  serine acetyltransferase  55.6 
 
 
273 aa  295  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2225  serine acetyltransferase  56.13 
 
 
273 aa  295  6e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000564542  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4136  serine acetyltransferase  55.6 
 
 
274 aa  295  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4361  serine acetyltransferase  55.02 
 
 
273 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0172  serine acetyltransferase  55.02 
 
 
271 aa  293  1e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3938  serine acetyltransferase  55.82 
 
 
273 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002243  serine acetyltransferase  56.22 
 
 
273 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00125  serine acetyltransferase  55.56 
 
 
273 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4080  serine acetyltransferase  54.62 
 
 
273 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2800  serine acetyltransferase  54.55 
 
 
273 aa  290  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933695  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0921  serine O-acetyltransferase  53.12 
 
 
264 aa  286  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0534835  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1084  Serine O-acetyltransferase  54.72 
 
 
277 aa  284  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.183103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3403  serine O-acetyltransferase  55.69 
 
 
272 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2624  serine O-acetyltransferase  52.76 
 
 
275 aa  281  8.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174291  normal  0.141631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3288  serine O-acetyltransferase  54 
 
 
286 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3752  serine O-acetyltransferase  53.36 
 
 
288 aa  278  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.547192  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1729  serine O-acetyltransferase  53.73 
 
 
272 aa  278  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2401  serine O-acetyltransferase  53.7 
 
 
285 aa  275  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2811  serine O-acetyltransferase  52.53 
 
 
285 aa  275  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3916  serine O-acetyltransferase  51.98 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.627699  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0880  serine O-acetyltransferase  50.59 
 
 
264 aa  273  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3144  serine O-acetyltransferase  52.61 
 
 
275 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.462561  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1437  Serine O-acetyltransferase  50.59 
 
 
280 aa  271  7e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2579  serine O-acetyltransferase  52 
 
 
273 aa  271  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2111  serine O-acetyltransferase  51.97 
 
 
286 aa  270  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0298655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2135  serine O-acetyltransferase  51.19 
 
 
302 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.159333  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2387  serine O-acetyltransferase  51.97 
 
 
286 aa  270  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0941  serine O-acetyltransferase  51.37 
 
 
272 aa  270  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2176  serine O-acetyltransferase  51.81 
 
 
276 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2063  serine O-acetyltransferase  51.97 
 
 
286 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1548  serine O-acetyltransferase  51.19 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000499697  hitchhiker  0.000167756 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1806  serine O-acetyltransferase  49.8 
 
 
269 aa  269  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.615997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1926  serine O-acetyltransferase  50 
 
 
274 aa  265  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1648  serine O-acetyltransferase  52.23 
 
 
272 aa  264  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500904  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3774  serine O-acetyltransferase  51.97 
 
 
283 aa  261  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2885  serine O-acetyltransferase  50.4 
 
 
279 aa  261  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236188  normal  0.13112 
 
 
-
 
NC_004310  BR1262  serine acetyltransferase  49.6 
 
 
266 aa  261  8e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2542  serine acetyltransferase  49.02 
 
 
274 aa  260  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1075  serine O-acetyltransferase  51.59 
 
 
268 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128961  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1224  serine acetyltransferase 4 (atsat-4) (atserat3;2)  49.2 
 
 
274 aa  259  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2161  serine O-acetyltransferase  51.95 
 
 
269 aa  259  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87889  serine acetyl transferase  48.03 
 
 
374 aa  258  6e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0926  serine O-acetyltransferase  51.19 
 
 
278 aa  258  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354725  normal  0.148148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5231  serine O-acetyltransferase  51 
 
 
275 aa  258  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026757  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0860  serine O-acetyltransferase  52.38 
 
 
274 aa  257  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0103482  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1568  serine O-acetyltransferase  49.41 
 
 
277 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1113  serine O-acetyltransferase  49.21 
 
 
275 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.860963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3208  serine O-acetyltransferase  50.78 
 
 
298 aa  255  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1765  serine O-acetyltransferase  49.42 
 
 
277 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465099  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0211  serine O-acetyltransferase  51.2 
 
 
312 aa  255  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.248006  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1146  serine O-acetyltransferase  50.2 
 
 
268 aa  254  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2481  serine O-acetyltransferase  50.2 
 
 
268 aa  254  9e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1091  serine O-acetyltransferase  49.8 
 
 
268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1067  serine O-acetyltransferase  50.39 
 
 
274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1773  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0595  serine O-acetyltransferase  51.9 
 
 
283 aa  248  9e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0792  Serine O-acetyltransferase  47.27 
 
 
288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4370  serine O-acetyltransferase  50 
 
 
282 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.844031  normal  0.0891787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1336  serine O-acetyltransferase  48.24 
 
 
281 aa  234  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1176  serine O-acetyltransferase  48.24 
 
 
281 aa  234  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  0.057909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3685  serine O-acetyltransferase  49.81 
 
 
272 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.189404 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0527  Serine O-acetyltransferase  46.09 
 
 
288 aa  229  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4892  serine O-acetyltransferase  48.22 
 
 
280 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_5580  predicted protein  44.23 
 
 
265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000587392  normal  0.0596868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1551  serine O-acetyltransferase  50.62 
 
 
293 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.11379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3386  serine O-acetyltransferase  48.69 
 
 
272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.224219 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1439  serine acetyltransferase protein  48.15 
 
 
271 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.247576  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1429  serine O-acetyltransferase  47.45 
 
 
290 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000018567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54880  putative serine acetyltransferase  50.83 
 
 
292 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000008722  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46665  predicted protein  45.19 
 
 
539 aa  208  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710949  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44289  predicted protein  40.16 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00762674 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  44.39 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  54.66 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  44.39 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  49.4 
 
 
240 aa  172  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0089  serine O-acetyltransferase  50.93 
 
 
223 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000290545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0085  serine O-acetyltransferase  50.93 
 
 
224 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>