More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3144 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3144  serine O-acetyltransferase  100 
 
 		 275 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.462561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2135  serine O-acetyltransferase  89.09 
 
 		 302 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.159333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3916  serine O-acetyltransferase  88.73 
 
 		 275 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.627699  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3288  serine O-acetyltransferase  89.09 
 
 		 286 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2579  serine O-acetyltransferase  88.28 
 
 		 273 aa  507  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2176  serine O-acetyltransferase  86.03 
 
 		 276 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5231  serine O-acetyltransferase  85.09 
 
 		 275 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026757  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1926  serine O-acetyltransferase  67.41 
 
 		 274 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646269  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1262  serine acetyltransferase  67.44 
 
 		 266 aa  384  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1224  serine acetyltransferase 4 (atsat-4) (atserat3;2)  65.19 
 
 		 274 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1729  serine O-acetyltransferase  70.98 
 
 		 272 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1113  serine O-acetyltransferase  68.97 
 
 		 275 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.860963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1765  serine O-acetyltransferase  68.85 
 
 		 277 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2542  serine acetyltransferase  67.18 
 
 		 274 aa  377  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1568  serine O-acetyltransferase  68.46 
 
 		 277 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2811  serine O-acetyltransferase  68.77 
 
 		 285 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2401  serine O-acetyltransferase  71.09 
 
 		 285 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2063  serine O-acetyltransferase  70.2 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2111  serine O-acetyltransferase  68.63 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2387  serine O-acetyltransferase  68.63 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0926  serine O-acetyltransferase  65.3 
 
 		 278 aa  363  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354725  normal  0.148148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3774  serine O-acetyltransferase  67.44 
 
 		 283 aa  358  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0211  serine O-acetyltransferase  63.81 
 
 		 312 aa  345  7e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.248006  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2624  serine O-acetyltransferase  60.31 
 
 		 275 aa  333  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174291  normal  0.141631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3208  serine O-acetyltransferase  64.84 
 
 		 298 aa  328  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1648  serine O-acetyltransferase  56.37 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1091  serine O-acetyltransferase  55.17 
 
 		 268 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2481  serine O-acetyltransferase  54.02 
 
 		 268 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1146  serine O-acetyltransferase  54.02 
 
 		 268 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3299  serine acetyltransferase  57.31 
 
 		 260 aa  306  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800758  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2161  serine O-acetyltransferase  55.34 
 
 		 269 aa  305  6e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1075  serine O-acetyltransferase  54.9 
 
 		 268 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128961  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2885  serine O-acetyltransferase  54.9 
 
 		 279 aa  296  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236188  normal  0.13112 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0792  Serine O-acetyltransferase  56.47 
 
 		 288 aa  295  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1084  Serine O-acetyltransferase  53.53 
 
 		 277 aa  292  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.183103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3752  serine O-acetyltransferase  54.69 
 
 		 288 aa  291  8e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.547192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1067  serine O-acetyltransferase  55.19 
 
 		 274 aa  290  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2225  serine acetyltransferase  54.55 
 
 		 273 aa  285  7e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000564542  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3979  serine acetyltransferase  55.04 
 
 		 273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.423159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3898  serine acetyltransferase  54.65 
 
 		 273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3917  serine acetyltransferase  54.65 
 
 		 273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4024  serine acetyltransferase  54.65 
 
 		 273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4085  serine acetyltransferase  54.65 
 
 		 273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3403  serine O-acetyltransferase  55.08 
 
 		 272 aa  281  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03465  serine acetyltransferase  53.88 
 
 		 273 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0098  serine O-acetyltransferase  53.88 
 
 		 273 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0101  serine acetyltransferase  53.88 
 
 		 273 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4035  serine acetyltransferase  53.88 
 
 		 273 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3944  serine acetyltransferase  53.88 
 
 		 273 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.863552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0128  serine acetyltransferase  54.26 
 
 		 273 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4980  serine acetyltransferase  53.88 
 
 		 273 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3819  serine acetyltransferase  53.88 
 
 		 273 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03416  hypothetical protein  53.88 
 
 		 273 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4111  serine acetyltransferase  53.88 
 
 		 273 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00125  serine acetyltransferase  53.36 
 
 		 273 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002243  serine acetyltransferase  52.57 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4078  serine O-acetyltransferase  52.61 
 
 		 259 aa  272  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4361  serine acetyltransferase  51.94 
 
 		 273 aa  271  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00201  serine acetyltransferase  52.51 
 
 		 268 aa  271  9e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.956846  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0154  serine acetyltransferase  51.6 
 
 		 265 aa  270  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3938  serine acetyltransferase  52.73 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0181  serine acetyltransferase  52.53 
 
 		 273 aa  269  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2800  serine acetyltransferase  51.38 
 
 		 273 aa  268  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0074  serine acetyltransferase  54.09 
 
 		 274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0080  serine acetyltransferase  54.09 
 
 		 273 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4136  serine acetyltransferase  53.7 
 
 		 274 aa  266  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4080  serine acetyltransferase  51.16 
 
 		 273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4814  serine acetyltransferase  52.71 
 
 		 273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193485 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0172  serine acetyltransferase  50.77 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0438  serine O-acetyltransferase  51.98 
 
 		 266 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1548  serine O-acetyltransferase  50 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000499697  hitchhiker  0.000167756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0921  serine O-acetyltransferase  49.41 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0534835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4170  Serine O-acetyltransferase  50.8 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0880  serine O-acetyltransferase  48.02 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1437  Serine O-acetyltransferase  46.85 
 
 		 280 aa  245  6e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87889  serine acetyl transferase  46.03 
 
 		 374 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1806  serine O-acetyltransferase  45.77 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.615997  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0941  serine O-acetyltransferase  46 
 
 		 272 aa  236  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1336  serine O-acetyltransferase  50.38 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0595  serine O-acetyltransferase  44.36 
 
 		 283 aa  235  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182262 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0527  Serine O-acetyltransferase  46.67 
 
 		 288 aa  235  6e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4370  serine O-acetyltransferase  47.33 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.844031  normal  0.0891787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3685  serine O-acetyltransferase  49.63 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.189404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1176  serine O-acetyltransferase  50 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  0.057909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3386  serine O-acetyltransferase  49.63 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.224219 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_5580  predicted protein  46.72 
 
 		 265 aa  225  7e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000587392  normal  0.0596868 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0860  serine O-acetyltransferase  45.49 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0103482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46665  predicted protein  44.44 
 
 		 539 aa  219  5e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710949  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4892  serine O-acetyltransferase  46.59 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1551  serine O-acetyltransferase  48.46 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.11379 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1429  serine O-acetyltransferase  47.23 
 
 		 290 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000018567 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44289  predicted protein  42.23 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00762674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54880  putative serine acetyltransferase  45.42 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000008722  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1439  serine acetyltransferase protein  39.92 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.247576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23070  serine O-acetyltransferase  47.37 
 
 		 242 aa  168  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000574255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  48.81 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  51.22 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2405  putative serine acetyltransferase  40.59 
 
 		 263 aa  165  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5017  Serine O-acetyltransferase  47.53 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2125  serine O-acetyltransferase  41.58 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.324489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>