34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1373 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1373  paREP12  100 
 
 
97 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.591291  normal  0.0165001 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1531  hypothetical protein  50 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.531742  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1530  IS605 family transposase OrfB  39.56 
 
 
413 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0242937  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1720  transposase, IS605 OrfB  38.46 
 
 
421 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.720564  normal  0.119776 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1447  transposase, IS605 OrfB  50 
 
 
443 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.303185  normal  0.469752 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1382  transposase, IS605 OrfB  50 
 
 
401 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0644  transposase, IS605 OrfB  47.22 
 
 
420 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0667565  hitchhiker  0.00187927 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1227  transposase, IS605 OrfB  50 
 
 
407 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.666406  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1390  transposase, IS605 OrfB  50 
 
 
460 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1179  transposase, IS605 OrfB  47.22 
 
 
416 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1427  hypothetical protein  47.46 
 
 
110 aa  57.8  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0960754 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1176  hypothetical protein  50 
 
 
304 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0124  transposase IS605 OrfB  48.28 
 
 
417 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00276741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0333  transposase, IS605 OrfB  50 
 
 
418 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.107927  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1333  IS605 family transposase OrfB  48.28 
 
 
477 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1064  transposase, IS605 OrfB  48.28 
 
 
485 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1033  transposase, IS605 OrfB  46.55 
 
 
440 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000086107 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0005  transposase, IS605 OrfB  41.94 
 
 
426 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.741123  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1279  transposase, IS605 OrfB  48.28 
 
 
423 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0586  transposase IS605 OrfB  42.47 
 
 
413 aa  55.1  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.732197 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1707  transposase IS605 OrfB  44.83 
 
 
420 aa  55.1  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00115032 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0334  hypothetical protein  52 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0288  transposase, IS605 OrfB  44.83 
 
 
420 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.125775  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0243  transposase, IS605 OrfB  46.55 
 
 
418 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.13657  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1462  transposase, IS605 OrfB  43.1 
 
 
421 aa  53.5  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1840  transposase, IS605 OrfB  46.55 
 
 
419 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.113531  hitchhiker  0.00220366 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1448  paREP12  33.33 
 
 
235 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.848284  normal  0.727251 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0846  hypothetical protein  46.43 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.109244 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1414  transposase, IS605 OrfB  43.1 
 
 
416 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1765  hypothetical protein  43.1 
 
 
276 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1086  hypothetical protein  51.02 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1731  transposase, IS605 OrfB  44.83 
 
 
326 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0821  paREP12  39.73 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0542334 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1304  hypothetical protein  44.64 
 
 
236 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.162924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>