72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2310 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2310  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
82 aa  169  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.598817 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1646  transposase IS3/IS911 family protein  77.78 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1382  putative transposase or inactivated derivative  73.17 
 
 
102 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1352  putative transposase  73.17 
 
 
102 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0537  putative transposase  73.17 
 
 
102 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2124  putative transposase  69.51 
 
 
101 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1842  transposase IS3/IS911 family protein  59.26 
 
 
102 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1370  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.885273  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  39.22 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  39.22 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  39.22 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  39.22 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  30.38 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  30.38 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  30.38 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0590  transposase IS3/IS911  30.67 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139932  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  30 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  31.43 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  31.43 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  31.43 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  31.43 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  31.43 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  28.75 
 
 
124 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  25 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  28.75 
 
 
124 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  25 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  28.75 
 
 
124 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1413  transposase IS3/IS911 family protein  29.31 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0015724  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  30.88 
 
 
374 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  30.88 
 
 
374 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  30.88 
 
 
374 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  30.88 
 
 
374 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 
374 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  30.88 
 
 
374 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  30.88 
 
 
374 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  23.68 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  23.68 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2001  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2772  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1692  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.325728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1675  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1673  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1662  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1657  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.803884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2136  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0920  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0586  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1682  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1686  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1880  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1887  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1975  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1992  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2013  transposase IS3/IS911  29.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00189647  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1295  transposase IS3/IS911 family protein  31.15 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  28.75 
 
 
133 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2699  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
390 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0773  transposase IS3/IS911 family protein  25 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1539  transposase  29.11 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0203174  normal  0.231759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  27.5 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
382 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
382 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
382 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
382 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
382 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
382 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
382 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  29.41 
 
 
124 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1306  transposase IS3/IS911  27.27 
 
 
100 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.273765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2284  transposase IS3/IS911  27.27 
 
 
100 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1712  transposase IS3/IS911  27.27 
 
 
100 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1654  transposase IS3/IS911  27.27 
 
 
100 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>