118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04861 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04861  hypothetical protein  100 
 
 
48 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05486  Transposase and inactivated derivatives  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000617192  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00091  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.522819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00306  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00556  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00786  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0152649  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01149  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.067728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01506  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01533  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01569  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01830  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01856  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01860  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01869  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.682708  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02307  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02536  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02754  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02778  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03121  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03203  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03683  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03876  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04159  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928838  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04493  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04613  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04843  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.881185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05467  hypothetical protein  95.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00485  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722368  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00615  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.716993  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01210  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01281  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391228  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02577  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03343  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03781  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04144  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
115 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.869497  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00621  ISXoo11 transposase  93.75 
 
 
115 aa  90.9  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.393839  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00645  transposase and inactivated derivatives  95.83 
 
 
86 aa  90.5  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.212129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01158  ISXoo11 transposase  93.75 
 
 
115 aa  90.9  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.597384  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02580  ISXoo11 transposase  93.75 
 
 
115 aa  90.5  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04117  ISXoo11 transposase  95.83 
 
 
86 aa  90.5  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.342243  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06091  hypothetical protein  95.83 
 
 
48 aa  90.5  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00931  hypothetical protein  95.83 
 
 
48 aa  90.5  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.78634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03990  hypothetical protein  95.83 
 
 
48 aa  90.5  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03129  ISXoo11 transposase  93.75 
 
 
115 aa  90.1  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01516  ISXoo11 transposase  93.75 
 
 
115 aa  88.2  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.40489  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04099  ISXoo11 transposase  91.67 
 
 
115 aa  88.6  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03382  ISXoo11 transposase  93.75 
 
 
115 aa  87.8  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447995  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6290  IS4 family transposase  80.43 
 
 
126 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464291  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6135  transposase IS4 family protein  78.26 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.766196 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6808  transposase IS4 family protein  78.26 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0355  IS4 family transposase  71.74 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0436  IS4 family transposase  71.74 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0573  IS4 family transposase  71.74 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0738  IS4 family transposase  71.74 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.728772  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0936  IS4 family transposase  71.74 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.156092  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0988  IS4 family transposase  71.74 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1519  IS4 family transposase  71.74 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2110  IS4 family transposase  71.74 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.305302  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2278  IS4 family transposase  71.74 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0266  IS4 family transposase  71.74 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0921  IS4 family transposase  71.74 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3272  IS4 family transposase  71.74 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33330  transposase IS4 family  54.35 
 
 
84 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49850  transposase IS4 family  54.35 
 
 
84 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.102835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10840  transposase IS4 family  54.35 
 
 
84 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09580  transposase IS4 family  54.35 
 
 
84 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.899796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23940  transposase IS4 family  54.35 
 
 
84 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36160  transposase IS4 family  54.35 
 
 
84 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15010  transposase IS4 family  54.35 
 
 
84 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  41.67 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  56.1 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  52.38 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0767  transposase IS4 family protein  43.48 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5627  hypothetical protein  48.89 
 
 
255 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751074  normal  0.528707 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  54.05 
 
 
260 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  54.05 
 
 
294 aa  43.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  53.66 
 
 
113 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  53.66 
 
 
113 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  50 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  50 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  50 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0325  hypothetical protein  45.65 
 
 
255 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  50 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0187  hypothetical protein  45.65 
 
 
255 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  53.66 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0244  hypothetical protein  45.65 
 
 
255 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  44.44 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  53.85 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  51.22 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.9 
 
 
251 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  51.43 
 
 
235 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0537  transposase, IS4 family protein  51.43 
 
 
193 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1753  ISCc1, transposase OrfB  50 
 
 
115 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303366  normal  0.533232 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5502  hypothetical protein  46.67 
 
 
255 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  57.14 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  57.14 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  57.14 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  57.14 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  57.14 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0593  transposase, IS4 family protein  47.37 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>