47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01176 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01176  serine peptidase  100 
 
 
90 aa  185  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0534  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.55 
 
 
698 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.709674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1792  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.67 
 
 
686 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0554398 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5651  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.65 
 
 
628 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.09 
 
 
1293 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.47 
 
 
1361 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  34.09 
 
 
1298 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  34.09 
 
 
1298 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  34.09 
 
 
1298 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  34.09 
 
 
1298 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.1 
 
 
396 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 
325 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2001  intracellular serine protease  36.36 
 
 
316 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1813  intracellular serine protease  36.36 
 
 
316 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1829  intracellular serine protease  36.36 
 
 
316 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1864  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 
316 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1767  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.39 
 
 
773 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1859  intracellular serine protease  36.36 
 
 
316 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.749891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  36.84 
 
 
1300 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  36.36 
 
 
316 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0023  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.38 
 
 
1008 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.421595  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.74 
 
 
1669 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  40.28 
 
 
298 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  40.28 
 
 
298 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 
797 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2930  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.15 
 
 
453 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.89 
 
 
392 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3306  intracellular serine protease  35.23 
 
 
315 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  35.23 
 
 
315 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.49 
 
 
1205 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.55 
 
 
749 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2035  intracellular serine protease  35.23 
 
 
316 aa  42  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2923000000000002e-27 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0271  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.96 
 
 
807 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769668 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2098  intracellular serine protease  35.23 
 
 
316 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  32.93 
 
 
535 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  30.68 
 
 
1300 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4652  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.91 
 
 
986 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0586324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6580  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.92 
 
 
519 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527476  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  48.98 
 
 
1489 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.67 
 
 
1383 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.71 
 
 
805 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000378195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.88 
 
 
490 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1569  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.88 
 
 
806 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2868  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.46 
 
 
540 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0927  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.88 
 
 
795 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.89 
 
 
558 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.14 
 
 
391 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  0.118221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>