94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3876 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1280  putative aminopeptidase 2  86.71 
 
 		 429 aa  785    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21990  putative aminopeptidase 2  79.49 
 
 		 429 aa  722    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000107017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1231  putative aminopeptidase 2  78.32 
 
 		 429 aa  717    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  0.319124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3989  putative aminopeptidase 2  86.71 
 
 		 429 aa  787    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.269888  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1690  putative aminopeptidase 2  86.71 
 
 		 429 aa  787    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1609  putative aminopeptidase 2  97.9 
 
 		 429 aa  870    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4132  normal  0.725509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1878  putative aminopeptidase 2  79.02 
 
 		 429 aa  721    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3876  aspartyl aminopeptidase  100 
 
 		 429 aa  888    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35150  putative aminopeptidase 2  80.89 
 
 		 429 aa  734    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1322  putative aminopeptidase 2  86.25 
 
 		 429 aa  784    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1730  putative aminopeptidase 2  86.48 
 
 		 429 aa  788    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0540022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1042  putative aminopeptidase 2  60.8 
 
 		 429 aa  529  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2884  putative aminopeptidase 2  57.04 
 
 		 432 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000479949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2231  putative aminopeptidase 2  53.41 
 
 		 432 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512559  hitchhiker  0.000110487 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1520  putative aminopeptidase 2  53.29 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00169382  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0913  putative aminopeptidase 2  50.47 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.250805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1777  putative aminopeptidase 2  50.24 
 
 		 419 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.238694  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1590  putative aminopeptidase 2  48.69 
 
 		 434 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75911  aspartyl aminopeptidase  41.51 
 
 		 489 aa  363  2e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.742072  normal  0.941207 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0577  putative aminopeptidase 2  42.08 
 
 		 431 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.743598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0588  putative aminopeptidase 2  41.61 
 
 		 431 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.617064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0961  putative aminopeptidase 2  45.07 
 
 		 452 aa  350  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0978242  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4174  putative aminopeptidase 2  46.17 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.290723  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10351  aspartyl aminopeptidase (AFU_orthologue; AFUA_3G08290)  40.34 
 
 		 497 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459837  normal  0.55908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0439  putative aminopeptidase 2  43.9 
 
 		 433 aa  338  8e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.773817  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27563  predicted protein  41.81 
 
 		 512 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0657659 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0829  putative aminopeptidase 2  39.81 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15270  putative aminopeptidase 2  43.35 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13136  predicted protein  41.43 
 
 		 465 aa  329  7e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.768968 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20708  predicted protein  42.56 
 
 		 475 aa  322  9.000000000000001e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558415  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3381  Aspartyl aminopeptidase  35.65 
 
 		 431 aa  316  4e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000123916  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0384  Aspartyl aminopeptidase  35.45 
 
 		 445 aa  315  9e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27719  predicted protein  38.67 
 
 		 506 aa  311  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02950  aminopeptidase, putative  37.97 
 
 		 502 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176961  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0385  putative aminopeptidase 2  37.26 
 
 		 424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0849  Aspartyl aminopeptidase  40.14 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4128  putative aminopeptidase 2  41.24 
 
 		 447 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0307  putative aminopeptidase 2  38.8 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0697  Aspartyl aminopeptidase  41.09 
 
 		 426 aa  288  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04970  putative aminopeptidase 2  39.29 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37690  aspartyl aminopeptidase  41.75 
 
 		 424 aa  286  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1636  putative aminopeptidase 2  38.73 
 
 		 421 aa  286  4e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0271553 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0024  putative aminopeptidase 2  35.96 
 
 		 431 aa  286  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3910  putative aminopeptidase 2  40.05 
 
 		 435 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10815  putative aminopeptidase 2  39.44 
 
 		 433 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1628  putative aminopeptidase 2  39.67 
 
 		 419 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4550  putative aminopeptidase 2  38.72 
 
 		 419 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52751  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4933  putative aminopeptidase 2  38.72 
 
 		 419 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4638  putative aminopeptidase 2  38.72 
 
 		 419 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23270  putative aminopeptidase 2  36.74 
 
 		 495 aa  280  4e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0333  Aspartyl aminopeptidase  36.64 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0647  putative aminopeptidase 2  35.39 
 
 		 423 aa  272  7e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.428879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5121  putative aminopeptidase 2  38.64 
 
 		 420 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674809 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26700  putative aminopeptidase 2  38.01 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0506  putative aminopeptidase 2  36.49 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0233423  normal  0.547995 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3612  Aspartyl aminopeptidase  40.79 
 
 		 417 aa  270  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11070  vacuolar aspartyl aminopeptidase Lap4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03990)  33.55 
 
 		 519 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.775985 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36090  predicted protein  28.86 
 
 		 508 aa  202  8e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47494  predicted protein  27.7 
 
 		 475 aa  166  8e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0741  putative aminopeptidase 1  27.66 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4129  peptidase M18 aminopeptidase I  26.21 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0402  peptidase M18 aminopeptidase I  25.23 
 
 		 460 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.057981  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0761  putative aminopeptidase 1  28 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.328835  normal  0.996362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18140  putative aminopeptidase 1  26.73 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000477052  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3061  putative aminopeptidase 1  27.46 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.756669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1926  putative aminopeptidase 1  26.73 
 
 		 476 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568897  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0481  putative aminopeptidase 1  26.53 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0643862  hitchhiker  0.00126414 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1076  putative aminopeptidase 1  24.66 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1263  putative aminopeptidase 1  25.12 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116209  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0368  putative aminopeptidase 1  24.94 
 
 		 458 aa  123  6e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4357  putative aminopeptidase 1  26.15 
 
 		 465 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0123  putative aminopeptidase 1  27.73 
 
 		 476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.870895 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0510  peptidase M18 aminopeptidase I  26.05 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000291545  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2589  putative aminopeptidase 1  25.89 
 
 		 468 aa  118  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.817656  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1300  peptidase M18 aminopeptidase I  24.37 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.044452  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1754  putative aminopeptidase 1  23.46 
 
 		 475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1741  putative aminopeptidase 1  26.65 
 
 		 461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2020  putative aminopeptidase 1  25.97 
 
 		 453 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000190862  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0394  peptidase M18 aminopeptidase I  25.16 
 
 		 473 aa  107  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2543  putative aminopeptidase 1  25.39 
 
 		 463 aa  106  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0378709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0726  putative aminopeptidase 1  25.8 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0567  putative aminopeptidase 1  24.53 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0613764  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0553  putative aminopeptidase 1  24.53 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000071726  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1530  putative aminopeptidase 1  23.71 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0908242  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01800  aspartyl aminopeptidase  23.9 
 
 		 475 aa  102  9e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000552066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3311  putative aminopeptidase 1  23.71 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2041  putative aminopeptidase 1  22.9 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3039  putative aminopeptidase 1  22.65 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0109252  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0269  putative aminopeptidase 1  24.45 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2226  putative aminopeptidase 1  26.42 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06730  aspartyl aminopeptidase  23.81 
 
 		 470 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0717904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1314  putative aminopeptidase 1  25.49 
 
 		 483 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000570668 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0400  peptidase M18 aminopeptidase I  29.94 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384737  normal  0.631826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  30.37 
 
 		 359 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>