93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0506 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0506  putative aminopeptidase 2  100 
 
 
452 aa  945    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0233423  normal  0.547995 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04970  putative aminopeptidase 2  55.08 
 
 
442 aa  483  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0577  putative aminopeptidase 2  41.71 
 
 
431 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.743598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0588  putative aminopeptidase 2  41.47 
 
 
431 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.617064  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0829  putative aminopeptidase 2  41.51 
 
 
430 aa  331  2e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3381  Aspartyl aminopeptidase  37.73 
 
 
431 aa  313  4.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000123916  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0384  Aspartyl aminopeptidase  37.73 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0961  putative aminopeptidase 2  37.79 
 
 
452 aa  280  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0978242  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75911  aspartyl aminopeptidase  33.4 
 
 
489 aa  278  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.742072  normal  0.941207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1609  putative aminopeptidase 2  37.41 
 
 
429 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4132  normal  0.725509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1042  putative aminopeptidase 2  37.3 
 
 
429 aa  275  8e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1231  putative aminopeptidase 2  37.01 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  0.319124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21990  putative aminopeptidase 2  37.21 
 
 
429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000107017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1878  putative aminopeptidase 2  36.99 
 
 
429 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4638  putative aminopeptidase 2  36.36 
 
 
419 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4933  putative aminopeptidase 2  36.36 
 
 
419 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4550  putative aminopeptidase 2  36.36 
 
 
419 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52751  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3876  aspartyl aminopeptidase  36.49 
 
 
429 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0385  putative aminopeptidase 2  34.71 
 
 
424 aa  270  5e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1730  putative aminopeptidase 2  38.02 
 
 
429 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0540022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3989  putative aminopeptidase 2  38.02 
 
 
429 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.269888  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1322  putative aminopeptidase 2  38.02 
 
 
429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2884  putative aminopeptidase 2  36.09 
 
 
432 aa  267  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000479949  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1520  putative aminopeptidase 2  35.42 
 
 
432 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00169382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1690  putative aminopeptidase 2  36.55 
 
 
429 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705107  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35150  putative aminopeptidase 2  36.16 
 
 
429 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1280  putative aminopeptidase 2  37.1 
 
 
429 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166488  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1628  putative aminopeptidase 2  37.53 
 
 
419 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0024  putative aminopeptidase 2  35.39 
 
 
431 aa  256  8e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4174  putative aminopeptidase 2  35.9 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.290723  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0307  putative aminopeptidase 2  33.96 
 
 
431 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0439  putative aminopeptidase 2  35.68 
 
 
433 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.773817  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27563  predicted protein  34.42 
 
 
512 aa  251  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0657659 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1777  putative aminopeptidase 2  34.65 
 
 
419 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.238694  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0849  Aspartyl aminopeptidase  34.91 
 
 
425 aa  249  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1590  putative aminopeptidase 2  36.1 
 
 
434 aa  249  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20708  predicted protein  35.37 
 
 
475 aa  246  4.9999999999999997e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558415  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0913  putative aminopeptidase 2  33.95 
 
 
419 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.250805  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5121  putative aminopeptidase 2  36.43 
 
 
420 aa  245  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.674809 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10351  aspartyl aminopeptidase (AFU_orthologue; AFUA_3G08290)  32.22 
 
 
497 aa  242  7.999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459837  normal  0.55908 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15270  putative aminopeptidase 2  32.72 
 
 
442 aa  241  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242124  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3612  Aspartyl aminopeptidase  35.5 
 
 
417 aa  240  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13136  predicted protein  33.92 
 
 
465 aa  240  4e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.768968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10815  putative aminopeptidase 2  35.93 
 
 
433 aa  239  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37690  aspartyl aminopeptidase  35.34 
 
 
424 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1636  putative aminopeptidase 2  33.81 
 
 
421 aa  237  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0271553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4128  putative aminopeptidase 2  34.08 
 
 
447 aa  237  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26700  putative aminopeptidase 2  33.85 
 
 
456 aa  234  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27719  predicted protein  32.45 
 
 
506 aa  232  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3910  putative aminopeptidase 2  34.09 
 
 
435 aa  229  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11070  vacuolar aspartyl aminopeptidase Lap4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03990)  30.22 
 
 
519 aa  225  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.775985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0333  Aspartyl aminopeptidase  32.17 
 
 
462 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02950  aminopeptidase, putative  32.43 
 
 
502 aa  224  3e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176961  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2231  putative aminopeptidase 2  33.88 
 
 
432 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512559  hitchhiker  0.000110487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0697  Aspartyl aminopeptidase  32.94 
 
 
426 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0647  putative aminopeptidase 2  30.07 
 
 
423 aa  206  7e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.428879  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23270  putative aminopeptidase 2  29.96 
 
 
495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36090  predicted protein  29.78 
 
 
508 aa  190  5.999999999999999e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47494  predicted protein  27.19 
 
 
475 aa  157  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1300  peptidase M18 aminopeptidase I  26.26 
 
 
471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.044452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0567  putative aminopeptidase 1  27.01 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0613764  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0553  putative aminopeptidase 1  27.01 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000071726  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0741  putative aminopeptidase 1  27.57 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0726  putative aminopeptidase 1  26.54 
 
 
500 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1263  putative aminopeptidase 1  26.04 
 
 
468 aa  123  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1076  putative aminopeptidase 1  25.82 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4129  peptidase M18 aminopeptidase I  26.39 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4357  putative aminopeptidase 1  25 
 
 
465 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2543  putative aminopeptidase 1  26.41 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0378709  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2041  putative aminopeptidase 1  25.34 
 
 
467 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1530  putative aminopeptidase 1  27.15 
 
 
446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0908242  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2226  putative aminopeptidase 1  29.11 
 
 
475 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0402  peptidase M18 aminopeptidase I  25.43 
 
 
460 aa  110  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.057981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1926  putative aminopeptidase 1  24.62 
 
 
476 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568897  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2589  putative aminopeptidase 1  24.84 
 
 
468 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.817656  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0368  putative aminopeptidase 1  25.05 
 
 
458 aa  108  3e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0269  putative aminopeptidase 1  24.18 
 
 
450 aa  107  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1754  putative aminopeptidase 1  26.21 
 
 
475 aa  106  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18140  putative aminopeptidase 1  25.92 
 
 
464 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000477052  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06730  aspartyl aminopeptidase  28.07 
 
 
470 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0717904  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3039  putative aminopeptidase 1  26.85 
 
 
468 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0109252  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0510  peptidase M18 aminopeptidase I  25.74 
 
 
445 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000291545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0123  putative aminopeptidase 1  25.17 
 
 
476 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.870895 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01800  aspartyl aminopeptidase  25.59 
 
 
475 aa  99.8  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000552066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3311  putative aminopeptidase 1  26.01 
 
 
476 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219105  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0394  peptidase M18 aminopeptidase I  24.25 
 
 
473 aa  95.9  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0761  putative aminopeptidase 1  25.86 
 
 
461 aa  93.6  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.328835  normal  0.996362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2020  putative aminopeptidase 1  27.51 
 
 
453 aa  87.8  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000190862  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0481  putative aminopeptidase 1  25.52 
 
 
467 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0643862  hitchhiker  0.00126414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3061  putative aminopeptidase 1  25.92 
 
 
464 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.756669  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1741  putative aminopeptidase 1  24.89 
 
 
461 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0400  peptidase M18 aminopeptidase I  26.56 
 
 
520 aa  73.2  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384737  normal  0.631826 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1314  putative aminopeptidase 1  25.12 
 
 
483 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000570668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>