93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2231 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2231  putative aminopeptidase 2  100 
 
 		 432 aa  896    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512559  hitchhiker  0.000110487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1280  putative aminopeptidase 2  55.06 
 
 		 429 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1730  putative aminopeptidase 2  55.16 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0540022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1322  putative aminopeptidase 2  55.16 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3989  putative aminopeptidase 2  55.4 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.269888  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1690  putative aminopeptidase 2  54.35 
 
 		 429 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21990  putative aminopeptidase 2  53.41 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000107017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1231  putative aminopeptidase 2  54.48 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  0.319124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1878  putative aminopeptidase 2  53.18 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3876  aspartyl aminopeptidase  53.41 
 
 		 429 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1609  putative aminopeptidase 2  53.65 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4132  normal  0.725509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35150  putative aminopeptidase 2  53.41 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1042  putative aminopeptidase 2  54.16 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2884  putative aminopeptidase 2  50.94 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000479949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1520  putative aminopeptidase 2  47.78 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00169382  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1777  putative aminopeptidase 2  46.41 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.238694  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0913  putative aminopeptidase 2  46.17 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.250805  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1590  putative aminopeptidase 2  42.45 
 
 		 434 aa  325  7e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0961  putative aminopeptidase 2  41.4 
 
 		 452 aa  317  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0978242  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0829  putative aminopeptidase 2  39.91 
 
 		 430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0577  putative aminopeptidase 2  41.4 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.743598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0439  putative aminopeptidase 2  39.77 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.773817  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0588  putative aminopeptidase 2  41.4 
 
 		 431 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.617064  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75911  aspartyl aminopeptidase  37.47 
 
 		 489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.742072  normal  0.941207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0307  putative aminopeptidase 2  38.86 
 
 		 431 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4174  putative aminopeptidase 2  40.24 
 
 		 437 aa  292  9e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.290723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3910  putative aminopeptidase 2  40.14 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0385  putative aminopeptidase 2  38.12 
 
 		 424 aa  289  6e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27563  predicted protein  38.64 
 
 		 512 aa  288  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0657659 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10351  aspartyl aminopeptidase (AFU_orthologue; AFUA_3G08290)  35.38 
 
 		 497 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459837  normal  0.55908 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20708  predicted protein  37.88 
 
 		 475 aa  284  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558415  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15270  putative aminopeptidase 2  38.46 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4128  putative aminopeptidase 2  39.86 
 
 		 447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0697  Aspartyl aminopeptidase  38.28 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23270  putative aminopeptidase 2  36.7 
 
 		 495 aa  276  6e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13136  predicted protein  38.95 
 
 		 465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.768968 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27719  predicted protein  35.82 
 
 		 506 aa  271  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3381  Aspartyl aminopeptidase  34.81 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000123916  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02950  aminopeptidase, putative  34.38 
 
 		 502 aa  268  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176961  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0384  Aspartyl aminopeptidase  35.86 
 
 		 445 aa  264  3e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1628  putative aminopeptidase 2  37.65 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26700  putative aminopeptidase 2  37.25 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1636  putative aminopeptidase 2  38.9 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0271553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5121  putative aminopeptidase 2  37.7 
 
 		 420 aa  259  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674809 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37690  aspartyl aminopeptidase  38.7 
 
 		 424 aa  256  4e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0333  Aspartyl aminopeptidase  35.89 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04970  putative aminopeptidase 2  35.32 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0849  Aspartyl aminopeptidase  36.11 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4550  putative aminopeptidase 2  36.68 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52751  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4933  putative aminopeptidase 2  36.68 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4638  putative aminopeptidase 2  36.68 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10815  putative aminopeptidase 2  36.7 
 
 		 433 aa  249  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0647  putative aminopeptidase 2  36.69 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.428879  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0024  putative aminopeptidase 2  33.65 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3612  Aspartyl aminopeptidase  37 
 
 		 417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0506  putative aminopeptidase 2  33.88 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0233423  normal  0.547995 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11070  vacuolar aspartyl aminopeptidase Lap4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03990)  31.45 
 
 		 519 aa  216  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.775985 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36090  predicted protein  32.49 
 
 		 508 aa  210  4e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47494  predicted protein  30.87 
 
 		 475 aa  179  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0402  peptidase M18 aminopeptidase I  25.77 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.057981  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0368  putative aminopeptidase 1  25.41 
 
 		 458 aa  113  7.000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0741  putative aminopeptidase 1  27.36 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4357  putative aminopeptidase 1  25.53 
 
 		 465 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1300  peptidase M18 aminopeptidase I  26.06 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.044452  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0726  putative aminopeptidase 1  25.23 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0510  peptidase M18 aminopeptidase I  25.6 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000291545  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2543  putative aminopeptidase 1  24.48 
 
 		 463 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0378709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3311  putative aminopeptidase 1  25.18 
 
 		 476 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0123  putative aminopeptidase 1  25.36 
 
 		 476 aa  96.7  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.870895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18140  putative aminopeptidase 1  25.76 
 
 		 464 aa  96.3  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000477052  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0269  putative aminopeptidase 1  24.35 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1926  putative aminopeptidase 1  25.93 
 
 		 476 aa  94.4  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568897  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1530  putative aminopeptidase 1  24.34 
 
 		 446 aa  94.4  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0908242  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0553  putative aminopeptidase 1  24.59 
 
 		 451 aa  93.6  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000071726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0567  putative aminopeptidase 1  24.59 
 
 		 451 aa  93.6  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0613764  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2226  putative aminopeptidase 1  25.64 
 
 		 475 aa  93.6  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01800  aspartyl aminopeptidase  23.71 
 
 		 475 aa  91.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000552066 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0761  putative aminopeptidase 1  25.17 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.328835  normal  0.996362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3061  putative aminopeptidase 1  23.34 
 
 		 464 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.756669  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0481  putative aminopeptidase 1  22.68 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0643862  hitchhiker  0.00126414 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1076  putative aminopeptidase 1  22.9 
 
 		 468 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1263  putative aminopeptidase 1  22.9 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2041  putative aminopeptidase 1  21.85 
 
 		 467 aa  86.3  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1754  putative aminopeptidase 1  23.98 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0394  peptidase M18 aminopeptidase I  23.15 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3039  putative aminopeptidase 1  22.84 
 
 		 468 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0109252  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06730  aspartyl aminopeptidase  23.26 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0717904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4129  peptidase M18 aminopeptidase I  24.59 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1741  putative aminopeptidase 1  24.94 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2589  putative aminopeptidase 1  22.25 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.817656  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1314  putative aminopeptidase 1  23.35 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000570668 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2020  putative aminopeptidase 1  22.51 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000190862  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0400  peptidase M18 aminopeptidase I  24.43 
 
 		 520 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384737  normal  0.631826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>