93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4174 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4174  putative aminopeptidase 2  100 
 
 
437 aa  873    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.290723  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15270  putative aminopeptidase 2  64.2 
 
 
442 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242124  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4638  putative aminopeptidase 2  56.32 
 
 
419 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4933  putative aminopeptidase 2  56.32 
 
 
419 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4550  putative aminopeptidase 2  56.32 
 
 
419 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52751  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1628  putative aminopeptidase 2  55.95 
 
 
419 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0849  Aspartyl aminopeptidase  56.34 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3612  Aspartyl aminopeptidase  56.74 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10815  putative aminopeptidase 2  54.44 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5121  putative aminopeptidase 2  56.09 
 
 
420 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.674809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0307  putative aminopeptidase 2  50.85 
 
 
431 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1590  putative aminopeptidase 2  47.16 
 
 
434 aa  360  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1280  putative aminopeptidase 2  48.35 
 
 
429 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166488  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1322  putative aminopeptidase 2  48.25 
 
 
429 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0697  Aspartyl aminopeptidase  49.76 
 
 
426 aa  354  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3989  putative aminopeptidase 2  47.79 
 
 
429 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.269888  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1730  putative aminopeptidase 2  47.55 
 
 
429 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0540022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3876  aspartyl aminopeptidase  46.17 
 
 
429 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35150  putative aminopeptidase 2  46.95 
 
 
429 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26700  putative aminopeptidase 2  46.14 
 
 
456 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1609  putative aminopeptidase 2  46.01 
 
 
429 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4132  normal  0.725509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1690  putative aminopeptidase 2  45.94 
 
 
429 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705107  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1231  putative aminopeptidase 2  45.71 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492379  normal  0.319124 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0439  putative aminopeptidase 2  45.54 
 
 
433 aa  336  5.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.773817  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1520  putative aminopeptidase 2  47.28 
 
 
432 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00169382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21990  putative aminopeptidase 2  46.03 
 
 
429 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000107017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1878  putative aminopeptidase 2  46.03 
 
 
429 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1636  putative aminopeptidase 2  43.06 
 
 
421 aa  333  5e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0271553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4128  putative aminopeptidase 2  45.23 
 
 
447 aa  331  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37690  aspartyl aminopeptidase  46.36 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0577  putative aminopeptidase 2  40.85 
 
 
431 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.743598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0588  putative aminopeptidase 2  40.85 
 
 
431 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.617064  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0961  putative aminopeptidase 2  43.22 
 
 
452 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0978242  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1042  putative aminopeptidase 2  42.39 
 
 
429 aa  316  5e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3910  putative aminopeptidase 2  44.39 
 
 
435 aa  315  9e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75911  aspartyl aminopeptidase  37.31 
 
 
489 aa  301  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.742072  normal  0.941207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2884  putative aminopeptidase 2  40.9 
 
 
432 aa  299  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000479949  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0829  putative aminopeptidase 2  38.79 
 
 
430 aa  294  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0333  Aspartyl aminopeptidase  41.85 
 
 
462 aa  295  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27563  predicted protein  42.16 
 
 
512 aa  293  4e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0657659 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0384  Aspartyl aminopeptidase  34.74 
 
 
445 aa  293  5e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0913  putative aminopeptidase 2  41.15 
 
 
419 aa  292  8e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.250805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2231  putative aminopeptidase 2  40.24 
 
 
432 aa  292  9e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512559  hitchhiker  0.000110487 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1777  putative aminopeptidase 2  40.24 
 
 
419 aa  288  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.238694  normal  0.291525 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10351  aspartyl aminopeptidase (AFU_orthologue; AFUA_3G08290)  37.42 
 
 
497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459837  normal  0.55908 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23270  putative aminopeptidase 2  39.71 
 
 
495 aa  286  5.999999999999999e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0024  putative aminopeptidase 2  35.58 
 
 
431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3381  Aspartyl aminopeptidase  34.12 
 
 
431 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000123916  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20708  predicted protein  40.57 
 
 
475 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558415  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13136  predicted protein  37.72 
 
 
465 aa  274  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.768968 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27719  predicted protein  36.72 
 
 
506 aa  269  5.9999999999999995e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04970  putative aminopeptidase 2  38.82 
 
 
442 aa  260  4e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0506  putative aminopeptidase 2  35.9 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0233423  normal  0.547995 
 
 
-
 
NC_006686  CND02950  aminopeptidase, putative  33.81 
 
 
502 aa  250  4e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176961  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0385  putative aminopeptidase 2  34.06 
 
 
424 aa  245  9e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0647  putative aminopeptidase 2  32.21 
 
 
423 aa  241  2e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.428879  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11070  vacuolar aspartyl aminopeptidase Lap4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03990)  30.77 
 
 
519 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.775985 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36090  predicted protein  29.37 
 
 
508 aa  211  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47494  predicted protein  27.73 
 
 
475 aa  149  8e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1926  putative aminopeptidase 1  26.64 
 
 
476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568897  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0402  peptidase M18 aminopeptidase I  27.69 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.057981  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1530  putative aminopeptidase 1  26.14 
 
 
446 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0908242  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0394  peptidase M18 aminopeptidase I  26.35 
 
 
473 aa  106  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0481  putative aminopeptidase 1  26.05 
 
 
467 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0643862  hitchhiker  0.00126414 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0761  putative aminopeptidase 1  27.11 
 
 
461 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.328835  normal  0.996362 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0726  putative aminopeptidase 1  24.37 
 
 
500 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2041  putative aminopeptidase 1  23.97 
 
 
467 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0510  peptidase M18 aminopeptidase I  30.14 
 
 
445 aa  97.1  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000291545  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1263  putative aminopeptidase 1  25.86 
 
 
468 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116209  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18140  putative aminopeptidase 1  26.65 
 
 
464 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000477052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0123  putative aminopeptidase 1  27.44 
 
 
476 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.870895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2226  putative aminopeptidase 1  25.72 
 
 
475 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1076  putative aminopeptidase 1  25.86 
 
 
468 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3061  putative aminopeptidase 1  25.56 
 
 
464 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.756669  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0741  putative aminopeptidase 1  24.19 
 
 
472 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06730  aspartyl aminopeptidase  28.2 
 
 
470 aa  90.1  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0717904  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1754  putative aminopeptidase 1  22.79 
 
 
475 aa  90.1  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0567  putative aminopeptidase 1  25.71 
 
 
451 aa  89.7  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0613764  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0553  putative aminopeptidase 1  25.71 
 
 
451 aa  89.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000071726  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4129  peptidase M18 aminopeptidase I  23.57 
 
 
458 aa  86.7  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0269  putative aminopeptidase 1  24.71 
 
 
450 aa  86.3  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1300  peptidase M18 aminopeptidase I  24.29 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.044452  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4357  putative aminopeptidase 1  24.89 
 
 
465 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1314  putative aminopeptidase 1  24.58 
 
 
483 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000570668 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3039  putative aminopeptidase 1  23.21 
 
 
468 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0109252  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01800  aspartyl aminopeptidase  25.83 
 
 
475 aa  80.9  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000552066 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1741  putative aminopeptidase 1  28.18 
 
 
461 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2589  putative aminopeptidase 1  25.19 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.817656  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3311  putative aminopeptidase 1  24.71 
 
 
476 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2543  putative aminopeptidase 1  24.61 
 
 
463 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0378709  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2020  putative aminopeptidase 1  27.59 
 
 
453 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000190862  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0400  peptidase M18 aminopeptidase I  27.35 
 
 
520 aa  67  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384737  normal  0.631826 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0368  putative aminopeptidase 1  18.47 
 
 
458 aa  63.9  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>