38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3227 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3227  hypothetical protein  100 
 
 		 42 aa  87  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0201844  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  92.68 
 
 		 6274 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  92.68 
 
 		 991 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  73.17 
 
 		 3563 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  73.17 
 
 		 2904 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  73.17 
 
 		 3443 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  70.73 
 
 		 5212 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  65 
 
 		 3602 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  55 
 
 		 1998 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  56.1 
 
 		 2600 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  58.54 
 
 		 3785 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  58.54 
 
 		 3884 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  57.5 
 
 		 3004 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  55 
 
 		 3079 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  52.5 
 
 		 2984 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  57.5 
 
 		 4966 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  57.5 
 
 		 3301 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  61.54 
 
 		 2545 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  56.1 
 
 		 3081 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  61.54 
 
 		 2588 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  55 
 
 		 3141 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  55 
 
 		 3141 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  55 
 
 		 3322 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  61.54 
 
 		 2530 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  52.5 
 
 		 2782 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  50 
 
 		 3501 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  50 
 
 		 3552 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  57.5 
 
 		 3159 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  50 
 
 		 3028 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  50 
 
 		 2421 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  55 
 
 		 3147 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  52.5 
 
 		 3526 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  52.5 
 
 		 3131 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0582  putative adhesin/hemolysin  57.89 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.588513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  50 
 
 		 3141 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.5 
 
 		 3020 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  50 
 
 		 3144 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  57.89 
 
 		 3350 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>