16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4826 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4826  type II secretion system protein  100 
 
 		 189 aa  363  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55460  type II secretion system protein  78.46 
 
 		 197 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000029628  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3176  general secretion pathway M protein  36.72 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317851  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2212  putative type II secretion system protein  34.78 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0018  general secretion pathway M protein  28.57 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00637635  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0052  general secretion pathway M protein  28.57 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0147385  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0071  general secretion pathway M protein  28.57 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0053  general secretion pathway M protein  30.77 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3234  general secretion pathway M protein  28.57 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  30.59 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  28.3 
 
 		 202 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4491  putative general secretory pathway protein M  28.57 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584495  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0042  general secretion pathway M protein  27.86 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0052  general secretion pathway M protein  27.86 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  26.53 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3946  General secretion pathway M protein  27.14 
 
 		 167 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487407  normal  0.51049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>