21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1538 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1538  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2830  hypothetical protein  43.58 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3831  hypothetical protein  36.44 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2372  hypothetical protein  40.16 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2368  hypothetical protein  39.68 
 
 		 222 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1738  hypothetical protein  36 
 
 		 215 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3002  hypothetical protein  35.43 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1915  hypothetical protein  34.2 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  0.31153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2938  hypothetical protein  36.78 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00388332  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1041  hypothetical protein  32.51 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3502  hypothetical protein  32.83 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.014829  hitchhiker  0.000163275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3591  hypothetical protein  37.35 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0636  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  92.4  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104231  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2327  hypothetical protein  33.7 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1958  hypothetical protein  31.42 
 
 		 216 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000494887  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1711  conserved hypothetical phage related protein  30.6 
 
 		 240 aa  86.3  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000232765  hitchhiker  4.3120600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1965  phage related protein  30.77 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0234296  normal  0.184059 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0622  hypothetical protein  28.86 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1546  hypothetical protein  36.7 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1570  hypothetical protein  35.78 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0322119  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1090  hypothetical protein  35.78 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00208664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>