22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1958 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1958  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000494887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1965  phage related protein  93.98 
 
 
216 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0234296  normal  0.184059 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3502  hypothetical protein  80.43 
 
 
230 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.014829  hitchhiker  0.000163275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3002  hypothetical protein  43.83 
 
 
223 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2372  hypothetical protein  40 
 
 
223 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2830  hypothetical protein  36.86 
 
 
214 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2368  hypothetical protein  39.48 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1711  conserved hypothetical phage related protein  34.62 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000232765  hitchhiker  4.3120600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1738  hypothetical protein  35.37 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1915  hypothetical protein  34.51 
 
 
248 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  0.31153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3831  hypothetical protein  32.16 
 
 
216 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181238 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0636  hypothetical protein  31.58 
 
 
177 aa  88.2  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104231  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1538  hypothetical protein  31.42 
 
 
250 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2938  hypothetical protein  30.58 
 
 
211 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00388332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3591  hypothetical protein  31.89 
 
 
239 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2327  hypothetical protein  29.74 
 
 
253 aa  79  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223617  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0622  hypothetical protein  32.23 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1041  hypothetical protein  27.8 
 
 
277 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186926  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1546  hypothetical protein  38.54 
 
 
207 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471697  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0477  hypothetical protein  25 
 
 
171 aa  58.2  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.369804  normal  0.245879 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1570  hypothetical protein  38.54 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0322119  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1090  hypothetical protein  38.54 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00208664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>