21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0622 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0622  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  471  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2938  hypothetical protein  36.29 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00388332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3591  hypothetical protein  35.89 
 
 
239 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2327  hypothetical protein  35.58 
 
 
253 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2830  hypothetical protein  37.77 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2372  hypothetical protein  37.21 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3002  hypothetical protein  31.51 
 
 
223 aa  95.1  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2368  hypothetical protein  35.44 
 
 
222 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1738  hypothetical protein  37.55 
 
 
215 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3502  hypothetical protein  34.44 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.014829  hitchhiker  0.000163275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1041  hypothetical protein  32.49 
 
 
277 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186926  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3831  hypothetical protein  32.03 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1915  hypothetical protein  32.66 
 
 
248 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  0.31153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1958  hypothetical protein  32.23 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000494887  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0636  hypothetical protein  31.94 
 
 
177 aa  77  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104231  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1965  phage related protein  31.12 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0234296  normal  0.184059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1538  hypothetical protein  28.86 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1711  conserved hypothetical phage related protein  40.37 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000232765  hitchhiker  4.3120600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1546  hypothetical protein  34.31 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471697  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1570  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0322119  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1090  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00208664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>