22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3002 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3002  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3502  hypothetical protein  60.61 
 
 		 230 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.014829  hitchhiker  0.000163275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1958  hypothetical protein  43.83 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000494887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1965  phage related protein  44.92 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0234296  normal  0.184059 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1738  hypothetical protein  34.69 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3831  hypothetical protein  35.68 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2830  hypothetical protein  35.93 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1041  hypothetical protein  31.23 
 
 		 277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2372  hypothetical protein  35.09 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1915  hypothetical protein  34.8 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  0.31153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1538  hypothetical protein  35.43 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2368  hypothetical protein  34.58 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3591  hypothetical protein  35.29 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2938  hypothetical protein  33.76 
 
 		 211 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00388332  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0622  hypothetical protein  31.51 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0636  hypothetical protein  30.59 
 
 		 177 aa  91.7  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104231  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1711  conserved hypothetical phage related protein  30.31 
 
 		 240 aa  86.7  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000232765  hitchhiker  4.3120600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2327  hypothetical protein  30.38 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223617  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1546  hypothetical protein  35.19 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1570  hypothetical protein  34.26 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0322119  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1090  hypothetical protein  34.26 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00208664  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0477  hypothetical protein  28.12 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.369804  normal  0.245879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>