19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1546 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1546  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471697  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1090  hypothetical protein  98.55 
 
 
207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00208664  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1570  hypothetical protein  98.55 
 
 
207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0322119  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2368  hypothetical protein  40.16 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1738  hypothetical protein  40.82 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2372  hypothetical protein  43 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2830  hypothetical protein  42.71 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1915  hypothetical protein  41.84 
 
 
248 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  0.31153 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2327  hypothetical protein  37.74 
 
 
253 aa  62  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223617  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3502  hypothetical protein  37.38 
 
 
230 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.014829  hitchhiker  0.000163275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3002  hypothetical protein  35.19 
 
 
223 aa  58.9  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1958  hypothetical protein  38.54 
 
 
216 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000494887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1538  hypothetical protein  36.7 
 
 
250 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1965  phage related protein  36.46 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0234296  normal  0.184059 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1711  conserved hypothetical phage related protein  36.43 
 
 
240 aa  54.7  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000232765  hitchhiker  4.3120600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3831  hypothetical protein  32.69 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181238 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1041  hypothetical protein  34.58 
 
 
277 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186926  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0622  hypothetical protein  34.31 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0636  hypothetical protein  29.9 
 
 
177 aa  45.1  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>