22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1041 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1041  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186926  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1738  hypothetical protein  35.42 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3002  hypothetical protein  31.23 
 
 
223 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1915  hypothetical protein  35.84 
 
 
248 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  0.31153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2830  hypothetical protein  34.66 
 
 
214 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2372  hypothetical protein  34.27 
 
 
223 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2368  hypothetical protein  34.74 
 
 
222 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3591  hypothetical protein  31.71 
 
 
239 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1538  hypothetical protein  32.51 
 
 
250 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2327  hypothetical protein  32.65 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223617  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0622  hypothetical protein  32.49 
 
 
228 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3831  hypothetical protein  30 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181238 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1965  phage related protein  30.5 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0234296  normal  0.184059 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3502  hypothetical protein  40.74 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.014829  hitchhiker  0.000163275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2938  hypothetical protein  27.84 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00388332  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1711  conserved hypothetical phage related protein  28.21 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000232765  hitchhiker  4.3120600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1958  hypothetical protein  27.8 
 
 
216 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000494887  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0636  hypothetical protein  31.48 
 
 
177 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104231  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1546  hypothetical protein  34.58 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471697  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1570  hypothetical protein  33.64 
 
 
207 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0322119  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1090  hypothetical protein  33.64 
 
 
207 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00208664  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0477  hypothetical protein  32.63 
 
 
171 aa  42.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.369804  normal  0.245879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>