52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82966 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_82966  Predicted transporter ADD1 (major facilitator superfamily)  100 
 
 		 624 aa  1268    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0628993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80441  multidrug efflux protein  33.62 
 
 		 606 aa  322  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476759  normal  0.0552674 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  22.48 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  20.61 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  22.48 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04530  expressed protein  23.08 
 
 		 917 aa  65.5  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  22.48 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  19.95 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45558  predicted protein  23.75 
 
 		 534 aa  64.3  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  21.53 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  22.12 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  21.35 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 411 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 		 408 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 427 aa  55.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  20.43 
 
 		 399 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 397 aa  54.3  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 415 aa  54.7  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  21.05 
 
 		 406 aa  54.3  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  27.81 
 
 		 396 aa  53.9  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  21.05 
 
 		 406 aa  53.9  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 416 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1598  transporter, major facilitator superfamily and tetracycline resistance protein  20.41 
 
 		 366 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 397 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  20.18 
 
 		 407 aa  53.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 397 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  28.21 
 
 		 434 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  22 
 
 		 405 aa  50.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  22.05 
 
 		 430 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 402 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  20.91 
 
 		 398 aa  49.7  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  21.47 
 
 		 408 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  20.85 
 
 		 422 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  21.19 
 
 		 405 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 426 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 412 aa  48.1  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 421 aa  47.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 		 406 aa  47.4  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 407 aa  47.4  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 387 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1621  tetracycline-efflux transporter  21.9 
 
 		 418 aa  45.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 442 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  22.63 
 
 		 411 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 415 aa  43.9  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  34 
 
 		 370 aa  43.9  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  21.34 
 
 		 397 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  24.21 
 
 		 411 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 426 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>