24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40211 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_40211  RTA protein  100 
 
 
269 aa  536  1e-151  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.147459  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29209  putative transporter or flippase transmembrane protein  54.31 
 
 
305 aa  298  5e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112208  normal  0.192439 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03509  conserved hypothetical protein  34.97 
 
 
310 aa  155  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03508  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01310)  39.44 
 
 
280 aa  152  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09111  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01970)  34.57 
 
 
295 aa  149  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.956666  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10770  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09550)  41 
 
 
301 aa  143  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.867047  hitchhiker  0.00634456 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08104  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01030)  39.9 
 
 
283 aa  142  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0651685 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02651  conserved hypothetical protein  29.11 
 
 
296 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.673154 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02342  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09900)  33.17 
 
 
297 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02669  conserved hypothetical protein  29.17 
 
 
341 aa  99.4  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61012  putative transporter or flippase transmembrane protein  29.03 
 
 
452 aa  91.3  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10947  normal  0.158279 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04912  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10770)  31.1 
 
 
311 aa  90.5  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825146  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67900  putative transporter or flippase  27.72 
 
 
507 aa  89.7  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0276377  normal  0.165515 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02355  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11810)  37.82 
 
 
221 aa  89.4  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.120645  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02798  conserved hypothetical protein  34.69 
 
 
136 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221186  normal  0.145812 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11208  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17890)  31.96 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.939789 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09374  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00920)  24.73 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.191288 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02080  expressed protein  25.98 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389797  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05350  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14140)  28.83 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000181467  hitchhiker  0.00389945 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02100  integral to membrane protein, putative  30.81 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.60169  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28287  putative transporter or flippase transmembrane protein  26.29 
 
 
514 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05100  conserved hypothetical protein  34.09 
 
 
286 aa  57  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00670  conserved hypothetical protein  24.6 
 
 
211 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03125  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12830)  22.62 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.603165  normal  0.970402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>